1，市場經濟下強烈的利益驅動。自給自足的小農生產不存在農產品質量安全問題。計劃經濟沒有現在的農產品質量安全問題。
2.農產品信息不完全導致市場機制失靈。學過經濟學的人都知道，市場機制充分發揮作用有三個假設:經濟人、完全信息、完全競爭。信息完整是指交易雙方充分掌握相關信息，以保證交易的完美和高效。按照這個假設，交易雙方都願意打，願意吃虧，雙方都願意。產品不安全的時候，雙方都清楚，所以不存在誰損害誰的問題，也不存在農產品質量安全的問題。
3.工業化對傳統農業生產的巨大影響。工業化對傳統農業的影響是雙重的。
4.收入水平提高後更加註重生命安全和生活質量。人們可能會有這樣的印象，隨著食品事件的曝光，似乎現在的食品絕對比過去差，食品安全問題解決得越多，水平越低。
5.農產品生產經營方式不適應。主要表現為增長方式不適應，農業組織體系不適應。中國農業客觀上存在粗放式增長。產出增長主要是通過增加化肥、農藥等投入來實現的。我國農業實行家庭式生產經營，組織化程度不高。
6.缺乏社會治理。中國仍處於經濟、政治和社會轉型的重要時期。政治和法律社會尚未完全形成。經濟面臨著經濟發展方式的轉變，從粗放經營向集約經營轉變，兩型社會建設才剛剛開始。社會受市場經濟影響，傳統倫理受到沖擊，重建社會道德秩序的任務十分繁重。
農產品質量安全問題的根源是什麽？僅此而已。