在北方農村，傳統的廁所糞便處理方法如下：有人說，廁所裏經常放置燒火做飯的草木，用於掩蓋糞便和殺死蒼蠅，滿的時候拿出來晾幹，搗碎後運到農田，培養出肥肥的地力，所以糞便最好的地方是農田。改造後的衛生間增加了儲存罐或建了化糞池，只是讓糞液等不再暴露，不能像城市壹樣和汙水壹起排放。這被稱為原來農村衛生間的“豪華版本”並不為過。這樣，問題是，用改造後的廁所、水將汙物排放到儲藏罐或糞桶中。水是必須的糞便變成糞液，儲存罐或糞桶的容量極其有限。按四人農戶計算，壹年中至少要清算三四次。
農家自己打掃。壹些農家，自己做的糞桶，糞車，壹點壹點地收拾，送到田裏當肥料，缺點是農忙季節，趕上滿地的糞額，會影響農作物的收獲和耕作。不在意的農戶壹大早壹夜利用無人的時間，將糞液倒進附近水坑溝，大部分用泥土掩埋，但需要很長時間，不在意的農戶可能會越來越多。這到處亂倒的糞液可能成為新的農村環境汙染物。這是各級地方政府和生態大環境所不允許的。
農村廁所糞便處理中采用了比較多的混合高溫堆肥法，城市在20世紀末已經應用，隨著這幾年的發展，處理技術也逐漸成熟。這種高溫堆肥方式整體衛生效果很好，操作也比較簡單。根據農村地區的氣候條件和肥料情況，考慮堆肥處理，高溫發酵，處理效率也相對較高。
采用農村廁所糞便處理、化糞池分解的方式，現在也有了很好的實踐。通過專業化的化糞池處理，可以保證整體處理效率，從目前的應用來看，以港口為主要品牌代表的SMC成型玻璃鋼化糞池具有較好的安全處理效率，整體和使用質感好，材料也講究，可以實現更好的保護性應用，支持較長的使用，花盆變處理效率也有了很大的提高。今天，各地農村廁所糞便處理中多采用比較獨立的化糞池處理方式，減少了很多這種繁雜的問題，確保了安全使用。