傳統的遺傳育種方法，如性能測定和選擇、遺傳改良預測、經濟育種目標和遺傳改良的傳遞系統等，是提高牦牛遺傳數量和質量的長期動力，交叉利用也是重要手段之壹。20世紀末，分子生物學和基因測序、基因定位等基因工程技術的發展揭開了牦牛育種的新篇章。分子標記技術是遺傳圖譜構建、主效基因測定、QTL精細定位、分子標記輔助選擇和標記輔助導入的基礎。基因芯片技術使分子標記技術更加快速、準確、經濟，更適合實際生產。基因工程技術的應用必須與傳統的遺傳育種技術和方法相結合。
(2)提高牦牛種群擴張速度——繁殖技術。
牦牛是壹種繁殖性能低下的家畜，性成熟晚，發情周期短，放牧的半野生生產方式都是牦牛繁殖性能低下的因素。提高我國牦牛業的生產水平，必須擴大高產優質牛的數量，而生殖生物技術是擴大優質牛數量的有效途徑。目前，成熟的生殖生物技術包括人工授精(AI)、超數排卵和胚胎移植(MOET)、體外受精(IVF)、胚胎分割、胚胎性別鑒定、X和Y精子分離和克隆。然而，唯壹成功應用於牦牛生產的繁殖技術是人工授精和MOET。
(3)牦牛生產的重要物質基礎——草地建設和飼養技術。
飼料是畜牧業生產的重要物質基礎。現代畜牧業和飼料工業對飼料原料有特殊的要求，牦牛業也不例外。由於牦牛生產方式的特殊性，草地建設成為重要環節。關鍵在於建立牦牛生產與草地利用(農業生態系統)的協調和相互利用，提高單位土地面積提供畜產品的效率。草原建設涉及的技術比較復雜，如優質牧草的培育、草原建設的解毒防鼠、草原的生態建設等。應用現代飼養技術改變現有的生產放牧方式，如溫室技術、育肥和飼養，有效改變傳統牦牛生產方式中“夏住、秋肥、冬瘦、春缺”的問題，也是提高牦牛生產性能的有效途徑。
(4)保證牛的健康——獸醫防疫技術
合理的動物保健計劃是肉牛健康生產的重要保證，控制疫病的爆發是提高牦牛業經濟效益的重要條件。利用現代生物技術，如單克隆技術、DNA重組技術等，制造生物效價高的疫苗，可有效控制疾病的發生。現代畜牧業科學技術很難應用到牦牛的實際生產中，因為畜群保健計劃是治療型而不是生產型，即牦牛生產沒有管理。
只有加強對牦牛生產方式的宏觀研究，把牦牛生產作為壹個系統，以現代科技為支撐，以草原建設為基礎，結合當地經濟、人口、生產結構和生產管理模式，提高科研成果的水平和轉化，完善牦牛生產體系，實現資源的優化配置和高效利用，牦牛才能發揮應有的資源優勢和經濟效益。