1.缺乏嚴謹有效的理論。
20世紀70年代以來，行為科學、代理理論和信息經濟學等各種相關科學的研究成果被引入管理會計，拓寬了管理會計的研究領域，修正了管理會計的壹些不合理假設。但相關科學的介紹並不全面系統，只是個別修正了管理會計的壹些假設。其中很多都只是停留在定性分析階段，缺乏實際應用價值。在實踐中，決策者往往無法準確衡量信息的成本和價值，因此無法分析信息的成本收益。
2.管理會計方法在實踐中的應用有很大的局限性。
由於傳統管理會計的理論是根據特定的經濟環境建立的，其許多定量模型和假設在不斷變化的現實經濟生活中無法成立，人們很難運用這些理論和模型解決實際問題。比如投資決策分析中貨幣時間價值的計算，所有的教材都是采用西方國家的復利制計算利息，而我國普遍采用的是單利制計算利息。這壹理論嚴重脫離實際，影響了其實際應用，以至於出現了“長期投資管理決策和長期投資敏感性分析在實踐中幾乎沒有被企業應用”的情況。另外，為了追求深不可測的理論和數學模型，有的把壹些原本簡單的方法復雜化，難以掌握，可操作性差。
3.實務界缺乏對管理會計的重視和系統應用。
自20世紀70年代末中國從西方引進管理會計知識體系以來，已有近30年的歷史。遺憾的是，近年來國內外及港臺地區會計學者的各種調查結果顯示，管理會計在中國企業中並未得到廣泛重視和系統應用。目前，管理會計的應用主要在沿海地區和外資企業，而在西部和內地應用較少。這主要是因為管理會計的基層教育滯後，普及率低。很多企業領導根本不懂管理會計，對其經濟效益沒有清晰的認識。會計人員素質低是制約管理會計推廣應用的關鍵，我國管理會計應用軟件發展滯後是制約其普及的重要因素。
4.管理會計應用經驗需要系統總結和提高。
管理會計已經成為許多高校會計專業的必修課，我國學術界對管理會計的研究也達到了壹定的深度。實事求是地說，我國壹些企業推行管理會計已經有了壹些成功的經驗，如70年代大慶油田的內部結算，80年代吉林省的廠內銀行，90年代邯鋼模擬市場核算，實行成本否決的經驗。然而令人遺憾的是，我國會計領域對實踐中的壹些典型成功案例明顯缺乏系統的研究和總結，迄今為止只有少數案例得到了系統的研究和總結。缺乏具有示範性或模型性的典型案例研究報告，是管理會計在中國企業沒有得到有效推廣應用的重要原因。
5.缺乏專業的管理會計師。
在中國企業中，管理會計的任務和職能基本上由財務部門和成本會計部門承擔。沒有專門的機構和專業人員承擔其任務和履行其職責，沒有專業的管理會計師隊伍，中國也沒有這樣的技術資格考試。由於企業著眼於會計循環，只考慮會計實務是否符合會計實務，而不考慮是否有利於企業戰略目標的實現，管理會計和財務會計發展不平衡，制約了其推廣應用。