忍者作為壹個職業，包括特工，以兩個知識體系為基礎；不僅學習更高級的戰鬥技巧和策略，還涉及較少的通靈知識
從13世紀到17世紀，日本無數忍者家族為了不同的目的，在不同的層面上做代理。每個家庭都有自己對代理人身份的具體需求。因為他們有的強調身體技能，有的強調心理警惕，有的強調政治聯系，但作為壹個真正的忍者，無論哪個家族，他們在以下八個方面都非常有見識:在忍者生活的每壹個活躍的日子裏，他面對的都是陌生的、全新的環境和情況，所以他的知識面不得不足夠寬廣，以應對任何出現的情況。大部分忍者的實用知識都可以用“通感”或者“意識”來代替。這種知識在常規的教育體系或者書本上是找不到的，所以忍術家族就靠口頭傳授和壹些有用的經驗來傳承祖先的知識。
基於忍者的高貴地位，遠不及有著嚴格榮譽和禮儀規則的武士，忍者可以在遺產中自由運用自然主義。忍術哲學強調宇宙萬物是相互聯系統壹的。因為人不可能壹眼看到整個世界，所以哲學解釋說宇宙的無數部分都是“萬物”，或者說萬物都是獨立存在的。看這個場景，壹切都可以歸為陰陽或者肯定和否定。舉例:明暗，天地，男女，強弱，幹濕，多樣，無數對極。
陰陽分類不僅僅是簡單的對立組合，它賦予了忍者壹種認知，讓他們擺脫了把事物分為對錯、好與壞、公平與不公平的局限。他們認為同壹性質的不同現象是相互聯系的。對於西方人來說，有時很難接受甚至理解這種松散的倫理或法律。的確，這種靈活性的概念與許多當代武術體系哲學理論相矛盾。忍者的人生觀以大局為重，千變萬化的結果比實現的方式更重要。
忍者最重要的政治貢獻是維持社會平衡與協調。如果說千軍萬馬的勇敢沖鋒是戰爭的前沿，那麽暗中截敵電或者自己俘虜敵人的長官就是對戰爭的否定或者節制和配合。敵人稱之為“欺騙、懦弱和背叛”，而忍者稱之為“策略、狡猾和機智”