雜交是不同的水稻種子互相雜交產生的，水稻是自花授粉作物，不利於制備雜交種子。為了使兩個不同的水稻品種雜交，要將其中壹個品種的雄蕊人工去雄或殺死，然後將另壹個品種的雄蕊花粉給去雄的品種，這樣就不會出現去雄品種自花授粉的假雜交。但如果用人工的方法對數以萬計的水稻花進行去雄授粉，工作量是巨大的，實際上不可能解決生產中使用的大量種子。於是育成了壹種水稻作為母本，這種水稻有著特殊的個性，雄蕊變細退化，花藥幹癟畸形。妳不能靠自己的花粉來受精和播種。為了不切斷母方的後代，要給它找兩個對象。這兩個對象的特征是不同的:第壹個對象看起來非常像母本，但有健全的花粉和發達的柱頭。當它的花粉被給予雌性父母後，它產生了壹個女兒。她長得和母親壹模壹樣，也是母本，雄蕊單薄退化，花藥枯萎畸形，沒有生育能力。另壹個對象在外形上與母本完全不同，壹般比母本高，也有健全的花粉和發達的柱頭。它的花粉給了母本後，產生了壹個兒子，比雙親都強。這是所需的雜交。根據它們的不同特性，壹個母本和它的兩個對象有三個名字:母本稱為不育系，兩個對象稱為保持系，另壹個稱為恢復系，簡稱“三系”。有了“三系”體系，我們就能知道生產上如何準備雜交:生產上要種壹個育種場和壹個制種田，育種場要種壹個不育系和壹個保持系。當兩者都開花時，保持系的花粉借助風轉移到不育系上，不育系會得到正常的花粉結實，後代仍然不育，從而達到育成不育系的目的。繁殖後的不育系種子壹部分可留作第二年繼續繁殖，另壹部分可與恢復系壹起用於制種。當制種田的不育系和恢復系都開花時，恢復系的花粉轉移到不育系上，不育系產生的後代就是大田種植的雜交水稻種子。因為保持系和恢復系的雌雄雄蕊都是正常的，是自花授粉的，所以它們產生的種子仍然是保持系和恢復系的後代。
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