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誰知道指紋和DNA怎樣鑒別

指紋是人類手指末端指腹上由凹凸的皮膚所形成的紋路。指紋能使手在接觸物件時增加摩擦力,從而更容易發力及抓緊物件。是人類進化過程式中自然形成的。 指紋由遺傳影響,由於每個人的遺傳基因均不同,所以指紋也不同。然而,指紋的形成雖然主要受到遺傳影響,但也有環境因素,當胎兒在母體內發育三至四個月時,指紋就已經形成,但兒童在成長期間指紋會略有改變,直到青春期14歲左右時才會定型。在皮膚發育過程中,雖然表皮、真皮,以及基質層都在***同成長,但柔軟的皮下組織長得比相對堅硬的表皮快,因此會對表皮產生源源不斷的上頂壓力,迫使長得較慢的表皮向內層組織收縮塌陷,逐漸變彎打皺,以減輕皮下組織施加給它的壓力。如此壹來,壹方面使勁向上攻,壹方面被迫往下撤,導致表皮長得曲曲彎彎,坑窪不平,形成紋路。這種變彎打皺的過程隨著內層組織產生的上層壓力的變化而波動起伏,形成凹凸不平的脊紋或皺褶,直到發育過程中止,最終定型為至死不變的指紋。 指紋有3種基本類型——環型、弓型和螺旋型。是皮下組織對指肚表皮頂壓方向的不同造就了這不同的類型。研究表明,如果某人指頭肚高而圓,其指紋的紋路將是螺旋型。現在,科學家已能夠通過模型再現那些較為常見的指紋,也能重復不太復雜的罕見指紋的形成過程。 目前尚未發現有不同的人擁有相同的指紋,所以每個人的指紋也是獨壹無二。由於指紋是每個人獨有的標記,近幾百年來,罪犯在犯案現場留下的指紋,均成為警方追捕疑犯的重要線索。現今鑒別指紋方法已經電腦化,使鑒別程序更快更準。 DNA的科普知識: 1 DNA指紋圖的建立及發展 近百年來的研究認為,任何遺傳分析都是以遺傳標誌為基礎的,而任何壹個遺傳標誌的價值又在於其變異 性(即多態性)的大小。有關遺傳多態性的研究對促進人類學、遺傳學、免疫學以及法醫學的發展, 以及對闡明某些疾病的發病機理乃至協助診斷等方面都起了十分重要的作用。但以往的研究都是利用各種外部表現型、生理缺陷型、同工酶、多態蛋白等作為遺傳標誌,用間接分析來推論相應的遺傳基因。 70年代末,限制性內切酶和重組體DNA技術的出現以及分子生物學的飛速發展,使人們對遺傳標誌的研究轉向DNA分子本身。由於各種遺傳信息都蘊藏在DNA分子上,生物個體間的差異在本質上是DNA分子的差異,因此DNA被認為是最可靠的遺傳標誌。某些DNA序列的差異可通過限制性酶切片段長度的改變來反映,此即限制性片段長度多態性(restriction fragment length polymorphisms,RFLP),其產生是由於點突變、DNA重排、插入或缺失引起的〔1〕。隨著對RFLP研究的深入,人們發現了基因組中最有變異性的壹類序列——高變異DNA序列,使DNA遺傳標誌的發展和應用得到了壹次飛躍。 1980年,Wyman和White描述了第壹個多等位性的具有高度多態性的人類DNA標誌。不久,在胰島素基因(Insulingene)的5′端區域、致癌基因(C-Haras I Oncogene)的3′端分別發現了相同的高度可變的標誌(hypervariable marker)。在α-球蛋白(α-globin)基因群周圍還發現了其它三個標誌〔2〕。1982年,Bell等〔3〕證實:這些高度多態性區域串聯著重復的短序列單位,重復單位數目的差異導致了這種高度的可變性,由於這些結構特征,人們稱這些區域為小衛星(minisatellite)或高度可變區域(hypervariable)或可變數目的串聯重復(variable number of tandem repeats)。 1985年,Jeffreys 等〔4〕用肌紅蛋白基因第壹內含子中的串聯重復序列(重復單位含33bp)作探針,從人的基因文庫中篩選出8個含有串聯重復序列(小衛星)的重組克隆。序列分析表明,這8個小衛星重復單位的長度和序列不完全相同,但都有相同的核心序列(core sequence)即GGCCAGGA/GGG。他們先後用兩個多核心小衛星(poly coreminisate -llite)33.6和33.15探針進行southern雜交,在低嚴謹條件下雜交得到了包含10多條帶的雜交圖譜,不同個體雜交圖譜上帶的位置就象人的指紋壹樣千差萬別,Jeffrey稱之為DNA指紋(DNA fingerprint)〔5〕,又名遺傳指紋(genetic fingerprint)。 RFLP DNA指紋分析技術由於方法繁雜、周期長、實驗條件高等缺陷而無法大範圍推廣。1990年,Williams等〔6〕首次報道了AP-PCR技術,Welsh和McCelland〔7〕亦獨立地進行了這方面的工作,從而使DNA指紋技術應用更加廣泛。AP-PCR技術是采用隨意設計的1個或2個引物,對模板DNA進行PCR擴增,壹般先是在低嚴格條件,即在高Mg2+濃度(大於傳統PCR Mg2+濃度1.5mmol/L)、較低退火溫度(36℃~50℃)下進行1~6個循環的PCR擴增,隨後在嚴格條件下進行PCR擴增,產物經2%瓊脂糖凝膠電泳或6%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,可得到DNA指紋圖譜。其基本原理是:在低嚴格復性條件下,引物與模板DNA非完全互補序列形成錯配,錯配引物在DNA聚合酶作用下沿模板鏈延伸,合成新鏈,當在壹定距離內模板DNA另壹單鏈也發生引物錯配時,即可對兩錯配引物間的DNA進行擴增。但是此種錯配並非隨機發生,引物和模板間,特別是在引物3′端必須存在壹定的互補序列,即可產生不同的擴增片段或組合,通過DNA指紋圖譜,可得到配對DNA樣品中的差異片段,用於克隆、測序、染色體定位和基因片段的生物學功能研究。 我國楊建廠等〔8〕利用PCR的原理成功地建立了壹種全新的DNA指紋檢測技術,稱之為隨機引物PCR人DNA指紋檢測技術(arbitrarily primed PCR human DNA fingerprinting,APHDP),此外還開發出處理DNA指紋數據應用軟件,應用於個人識別、遺傳素質與疾病的相關特征研究等。 DNA指紋的識別 ________________________________________ 1984年英國萊斯特大學的遺傳學家Jefferys及其合作者首次將分離的人源小衛星DNA用作基因探針,同人體核DNA的酶切片段雜交,獲得了由多個位點上的等位基因組成的長度不等的雜交帶圖紋,這種圖紋極少有兩個人完全相同,故稱為"DNA指紋",意思是它同人的指紋壹樣是每個人所特有的。DNA指紋的圖像在X光膠片中呈壹系列條紋,很像商品上的條形碼。DNA指紋圖譜,開創了檢測DNA多態性(生物的不同個體或不同種群在DNA結構上存在著差異)的多種多樣的手段,如RFLP(限制性內切酶酶切片段長度多態性)分析、串聯重復序列分析、RAPD(隨機擴增多態性DNA)分析等等。各種分析方法均以DNA的多態性為基礎,產生具有高度個體特異性的DNA指紋圖譜,由於DNA指紋圖譜具有高度的變異性和穩定的遺傳性,且仍按簡單的孟德爾方式遺傳,成為目前最具吸引力的遺傳標記。 DNA指紋具有下述特點:1.高度的特異性:研究表明,兩個隨機個體具有相同DNA圖形的概率僅3×10-11;如果同時用兩種探針進行比較,兩個個體完全相同的概率小於5×10-19。全世界人口約50億,即5×109。因此,除非是同卵雙生子女,否則幾乎不可能有兩個人的DNA指紋的圖形完全相同。2.穩定的遺傳性:DNA是人的遺傳物質,其特征是由父母遺傳的。分析發現,DNA指紋圖譜中幾乎每壹條帶紋都能在其雙親之壹的圖譜中找到,這種帶紋符合經典的孟德爾遺傳規律,即雙方的特征平均傳遞50%給子代。3.體細胞穩定性:即同壹個人的不同組織如血液、肌肉、毛發、精液等產生的DNA指紋圖形完全壹致。 1985年Jefferys博士首先將DNA指紋技術應用於法醫鑒定。1989年該技術獲美國國會批準作為正式法庭物證手段。我國警方利用DNA指紋技術已偵破了數千例疑難案件。DNA指紋技術具有許多傳統法醫檢查方法不具備的優點,如它從四年前的精斑、血跡樣品中,仍能提取出DNA來作分析;如果用線粒體DNA檢查,時間還將延長。此外千年古屍的鑒定,在俄國革命時期被處決沙皇尼古拉的遺骸,以及最近在前南地區的壹次意外事故中機毀人亡的已故美國商務部長布朗及其隨行人員的遺骸鑒定,都采用了DNA指紋技術。 此外,它在人類醫學中被用於個體鑒別、確定親緣關系、醫學診斷及尋找與疾病連鎖的遺傳標記;在動物進化學中可用於探明動物種群的起源及進化過程;在物種分類中,可用於區分不同物種,也有區分同壹物種不同品系的潛力。在作物的基因定位及育種上也有非常廣泛的應用。 DNA指紋圖譜法的基本操作:從生物樣品中提取DNA(DNA壹般都有部分的降解),可運用PCR技術擴增出高可變位點(如VNTR系統,串聯重復的小衛星DNA等)或者完整的基因組DNA,然後將擴增出的DNA酶切成DNA片斷,經瓊脂糖凝膠電泳,按分子量大小分離後,轉移至尼龍濾膜上,然後將已標記的小衛星DNA探針與膜上具有互補堿基序列的DNA片段雜交,用放射自顯影便可獲得DNA指紋圖譜。 瓊脂糖凝膠電泳是分離,鑒定和純化DNA片段的常規方法。利用低濃度的熒光嵌入染料-溴化乙錠進行染色,可確定DNA在凝膠中的位置。如有必要,還可以從凝膠中 回收DNA條帶,用於各種克隆操作。瓊脂糖凝膠的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝膠低,但其分離範圍較廣。用各種濃度的瓊脂糖凝膠可以分離長度為200bp至近50kbp的DNA。長度100kb或更大的DNA,可以通過電場方向呈周期性變化的脈沖電場凝膠電泳進行分離。 在基因工程的常規操作中,瓊脂糖凝膠電泳應用最為廣泛。它通常采用水平電泳裝置,在強度和方向恒定的電場下進行電泳。DNA分子在凝膠緩沖液(壹般為堿性)中帶負電荷,在電場中由負極向正極遷移。DNA分子遷移的速率受分子大小,構象。電場強度和方向,堿基組成,溫度和嵌入染料等因素的影響。 2 DNA指紋技術所用的探針 自DNA指紋技術建立以來,這壹技術迅速在動植物的進化關系、親緣關系分析以及法醫學方面得到廣泛應用。也正是由於DNA指紋技術在核酸分析中顯示出了強大的生命力,因而許多學者圍繞此技術所用的探針作了大量的工作,除Jeffrey等〔5〕的探針外,用人工化學合成或從生物組織中提取後再擴增的辦法生產出了壹批高水平的探針。迄今,在DNA指紋技術中所用的探針大概有probe33.15、33.6〔5〕、bacteriophage MB〔9〕、pig repetitire clone p83、PGB 725、poly(GT) containing 18.1、(GTG)5/(CAC)5〔10,11〕、(CAC/TA)4及(GT)12等。同時,在探針的標誌上也有了很大的發展,根據它們的結構可大致分為小衛星探針和簡單重復序列探針,簡單重復序列包括微衛星探針(microsatellite probe)和寡聚核苷酸探針。小衛星探針的核心序列為33bp,常定位在人常染色體前的末端(proterminal)區域,微衛星探針則在10~20bp之間,而寡聚核苷酸探針在10bp以下,普遍散布在人類整條染色體上,或者在基因間區域或者位於內含子內。 1988年,我國伍新堯等〔12〕根據DNA指紋是人基因組中重復序列的RFLP的原理和人與鼠的髓鞘堿性蛋白(MBP)基因cDNA同源序列性高於90%的事實,選用鼠MBP cDNA3′端的壹段序列(非表達區高度重序列,與人基因組中該類重復序列幾乎完全同源),長度為0.81kb的片段作探針,檢測用HaeⅢ酶解的人DNA限制性片段(RF),在人群中可分出22條譜帶,受檢 的30例無血緣關系的個體之間沒有兩個人的譜帶是完全相同的,顯示這壹方法的高度個體特異性,這是國內首次用自已的力量找到DNA指紋的探針。 3 DNA指紋的應用3.1 法醫學方面 同以往的血型測定法相比,DNA指紋技術在法醫學領域上具有無可比擬的優越性。已成為鑒定犯罪、親子鑒定和確定個體間親緣關系的工具〔5,13〕。隨後,國內學者李伯齡〔14〕、姜先華〔15〕、伍新堯等〔12〕也先後對此項技術進行了研究,並應用於實際案件的鑒定中,解決了過去無法解決的疑難案例,如微量血痕、部分腐敗的碎屍塊的個人認定等。 3.2 在動植物科學中的應用 3.2.1 生物種群學研究 利用DNA指紋圖可以估算連鎖不平衡,比較等位基因的頻率,還能估計不同個體之間的重組率,在種群學研究上有助於建立某壹個體在種群中的地位和關系,特別是對真菌的種群研究,有很多真菌可以通過有性和無性的方式繁殖,但是何時以何種方式繁殖,程度如何,並不清楚,而利用DNA指紋圖就能區分以有性和無性方式產生的後代,並能確定某壹區域真菌的自然分布〔1,16〕。 3.2.2 測定物種之間的遺傳距離、物種分類鑒定 Jeffreys等〔5〕認為在壹個群體的不同成員間拷貝數的串聯重復序列(VNTR)由於多態性程度高,在遺傳分析中尤其適合作為多態性標誌,簡單重復的不穩定性可導致VNTR長度的迅速變化,根據家族中或育種群體中VNTR的分離重組頻率,可以測定出遺傳距離,可用統計學公式確定個體間的親緣關系:D=2Nab/(Na+Nb),,D值越大,親緣關系越近,遺傳距離就越小;D值越小,親緣關系越遠,遺傳距離就越大。為此,運用DNA指紋技術可檢測不同物種、同種及同種不同個體的親緣關系,用於物種分類鑒定,也可用於雜交後代親本決定,雜交後代群體分開,檢測近等基因系(或同類系)種的多態性,並對檢測基因進行定位。Welsh等〔7〕對布氏疏螺旋體菌株的DNA指紋進行分析,發現這種lyme病的病原菌實際上是由三個不同的種群組成。羅超權等〔12〕運用AP-PCR鑒定弓形蟲蟲株,在國內開創了運用DNA指紋技術作生物分類的先例。 3.3 在流行病學方面的運用 由於DNA指紋具有以下幾個特點:①能反映基因組的變異性;②具有高度的變異性;③具有簡單的穩定的遺傳性;④DNA指紋譜具有體細胞穩定性。所以,它同壹般的流行病學方法相比較而言,具有無比的優越性,使其成為流行病調查的壹種有效工具。Jan DA等〔17〕,Denise Chevrel-Dellagi等〔18〕運用IS6110序列作探針對結核病分支桿菌株進行DNA指紋分析,調查國際間結核病的種型、分析流行情況,改進了控制結核病的方法。而ZhenHua Yang等〔19〕從67個病人中分離出結核病分支桿菌株進行DNA指紋分析,發現分離到PTBN12型時易查明流行環節,從而為快速進行疾病控制提供了壹個有力證據。在我國,童笑梅等〔20〕采用隨機擴增多態DNA指紋圖技術對醫院內感染的14例新生兒進行病原流行病學分析,發現患兒體內攜帶的與醫務人員鼻中攜帶的華納葡萄球菌菌株的DNA指紋圖完全壹致,從而證明此次感染的病原菌為華納葡萄球菌,傳染源是攜帶病菌的醫務人員。郭永建等〔21〕在6個月內對121名產科新生兒中的30名檢出的31株銅綠假單胞菌進行RAPD指紋圖譜分析和血清學分型,結果表明,銅綠假單胞菌在產科新生兒中暴發流行,0∶6/R∶1型為暴發流行性菌株,對醫院感染病原菌分型、精確確定傳染源、阻斷傳播途徑、控制和預防醫院感染具有重要的指導意義。 3.4 疾病診斷及治療 鑒於DNA指紋所具有的上述特點,故DNA指紋廣泛應用於壹些疾病的診斷及治療。Morral〔22〕等發現CF基因9號外顯子側翼含有壹小衛星區,且此等位基因2.6帶常與△F508連鎖,相伴率為50.6%、41.6%,△F508是最主要的致病突變,可疑患者電泳圖只要發現2.6等位基因,就可對此病進行初步診斷。現已在Wilson病、外周神經纖維瘤、成人多束腎、多巴性肌緊張、Frecbreich***濟失調、Kallmunm綜合征性連鎖、視網膜病等基因內或旁側發現有高度的小衛星區域,從而可進行基因診斷。Okamoto R〔23〕用DNA指紋法預測慢性粒cell性白血病骨髓移植術後復發,取得了成功。 3.5 腫瘤的研究 腫瘤是多因素、多階段的變化過程,病因復雜、變化多樣,但歸根到底還是在DNA的變化上。壹般說來,癌組織、轉移竈與正常組織或外周血細胞DNA指紋有差別,常見的是某條帶或幾條帶的缺失,某壹條或某幾條帶密度降低,或者癌組織中出現新的帶。Thein等〔24〕用33.6和33.15為探針研究患者DNA指紋譜變化,發現胃腸腫瘤患者癌組織DNA指紋譜全有改變,並認為體細胞突 變還有種屬特異性。劉霜等〔25〕應用RAPD(隨機擴增多態性DNA)分析技術對6例肝癌患者的癌組織與非癌組織進行分析,發現所有肝癌組織基因組DNA的RAPD指紋圖譜均存在差異,其中3例配對肝癌基因組中均存在壹相同的0.9Kb的隨機擴增片段。楊建廠等〔8〕用APHDFF技術對28例確診為鼻咽癌病人血DNA指紋圖的檢測,發現有3條DNA片段出現的頻率明顯低於健康人群。王黛等〔26〕用LE11.8、MYO和Mb探針,經Southern雜交法檢測12例兒童急性粒cell白血病患者的外周血或骨髓細胞的基因重排,結果發現初始或復發與完全緩解時的DNA指紋圖相比,譜帶有增加或減少,從而認為急性粒細胞白血病患兒的白血病細胞存在基因重排。

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