明朝和清朝是我國最後兩個封建王朝，此時封建的制度已經跟不上時代的步伐了。所以出現了壹些批判的聲音，而在封建王朝自從漢朝罷黜百家獨尊儒術以後，傳統思想的主流就是儒學。所以，在明清時期對於儒學的批判開始興起，其中最重要的是對於儒學所倡導的君主專制、脫離實際以及追求功名的批判之聲。
壹、批判君主專制君主專制在中國存在了近兩千年後的明清時期，壹些進步人士明顯感受到了文化和經濟之間的脫節。明朝時期我國已經出現了資本主義萌芽，所以君主專制已經不符合時代要求了。其中主要代表是顧炎武和黃宗羲，黃宗羲反對君主專制，顧炎武則批判君主專制下的腐敗。
二、批判脫離實際對於儒學所倡導的?本心?格物致知?的思想，更多的是思考和死讀書下的科舉。尤其是到了明朝，因為有了文字獄，人們的思想戴上了枷鎖，又興起了八股僵化了思想使得壹些文人批判傳統儒學的脫離實際。其中最著名的是顧炎武提出的實踐出真知的思想，他認為知識需要去實踐中發現而不是脫離實際的空談。
三、批判追求功名這壹點，在清朝文學家曹雪芹所著《紅樓夢》中大有提現。在《紅樓夢》裏，賈寶玉的離經叛道是曹雪芹先生表達地對於社會上過分追求功名的思想的批判。在明清時期，商業的發展已經非常接近於近代但由於傳統儒學的?士農工商?的思想下壹直被打擊而得不到發展，社會出現了病態的追求功名的潮流，也使得壹些人對比進行了辛辣的諷刺批判，比如吳敬梓的《儒林外史》中描寫的範進中舉就是典型。