曙光醫院最出名科室是肝病壹科。
如下：
上海中醫藥大學附屬曙光醫院分為東西兩部，西部位於普安路185號，占地28畝，東部位於張衡路528號，占地160畝，是壹所三級綜合性中醫院，是上海市醫保定點單位。2021年8月，上海中醫藥大學附屬曙光醫院呼吸與危重癥醫學科護理組被評選為第20屆全國青年文明號。
醫院設有腦病科、脾胃病科、風濕病科、心血管內科、肝病科、肝硬化專科、腎病壹科、腎病二科、肺病科、血液內科、內分泌科、腫瘤科、老年醫學科、傳統中醫科、神經外科、心胸外科、普外科、乳腺外科、肝膽外科、泌尿外科、周圍血管外科、中醫外科、胃腸外科。
胰膽外科、乳腺科等臨床醫技科室。其中，國家教育部重點學科3個：中醫骨傷科學、中醫內科學、中藥學（中藥制劑、中藥臨床藥理）；國家中醫藥管理局重點學科6個：中醫肝病學、中醫腎病學、中醫傳染病學、中西醫結合臨床外科學、中醫信息學和中醫護理學。
衛生部臨床重點專科6個：肝病科、骨傷科、心血管科、腎病科、內分泌科、臨床藥學；中管局重點專科12個：腎病科、內分泌科、脾胃病科、心血管科、針灸科、肛腸科、肺病科、婦科、急診科、重癥醫學科、護理學、臨床藥學。
另外，醫院還建立了7個全國名老中醫藥專家傳承工作室和12個上海市名中醫工作室。醫院開放床位1320張，配備核磁***振成像系統（MRI3.0T）、CT-BrillianceiCT（極速，256層CT）。
通用血管造影系統DSA（Artis zeego）、骨關節成像系統、手術導航系統、脊柱微創手術系統、鈥激光手術系統、彩色多普勒超聲系統、舌面脈信息采集體質辨識系統、全自動發藥機等醫療設備。