有機肥與傳統肥料相比優勢在於：
有機肥營養元素全面，是壹種全元素肥料，作物生長不易造成缺素癥。
有機肥養分釋放緩慢，肥效持久。
有機肥料可改善土壤環境，提升土壤的緩沖性，提高蓄水肥能力。
有機肥原料來源廣泛，畜禽糞便、動植物殘體、泥碳、城市垃圾等都可做生產原料。
隨著人們對環境和食品安全要求的提高，增施有機肥減少化肥用量大勢所趨，有機肥應用前景廣闊。
值得註意的是有機肥必須要充分腐熟才能施用，否則會引起燒苗或病蟲害發生。同時要適當配合化肥，以滿足作物在不同生育時期的養分需求，做好這兩點就能達到用地養地，高產穩產的目的。
有機肥是農村人就地取材、就地漚制、就地使用的農家肥；其中主要以動植物殘體、人畜糞尿、豆麩等為主。現在大量使用的商品有機肥基本上也都是在農家肥的基礎上，采用了更先進技術進行發酵、殺菌、除臭等制成，具有施用方便、見效快的優點。
早幾年，為了大幅度提高產量，大量的無機化學肥連續無節制地長期使用，導致了土壤板結，中微量元素極度匱乏。如今單靠增加化肥用量來取得高產已經越來越難，唯有靠有機肥來增加土壤有機質，改善土壤營分結構，才能持續穩定地生產高質量的農副產品。
現在，人們的生活水平己經普遍提高了，吃飽穿暖之後，吃好吃的健康成為大家的日常需求。如何生產出更多無毒無汙染而且養分全面的農產品呢？只有有機肥的大量使用，再輔以少量的無機肥配合才是最好的途徑。因此，隨著人們對種植技術的日益重視，有機肥的使用肯定會越來越多，並且優質的商品有機肥將更會得到種植者的追奉。
有機肥主要是動物糞便和植物稭稈在通過微生物發酵產生的，有機肥的主要作用是改善土壤結構，恢復土壤肥力的，有機肥還是壹個長效肥，它的肥力是慢慢釋放出來的，對植物生長很有幫助。有機肥還是壹種復合肥，其中含有植物生長需要的所有元素。
而傳統的化肥壹般都是短效單方肥，肥力強釋放的也快，沒有被吸收的都會被浪費掉，同時這些化肥還會殺死土壤中的壹些生物改變土壤的結構，這也是為什麽現在田裏的蚯蚓泥鰍等等消失的原因。
說現在都提倡使用有機肥，在國外有機肥是有專門的生產廠家，唯壹的問題是有機肥的使用量比較大，所以這也導致使用有機肥的成本比較幹。對於現在農產品的附加值低的情況下，使用有機肥是虧本的，所以推廣遇到困難。