1.膽囊切除術後的危害可能會造成肝損害和結腸損害。目前己證實石膽酸對肝細胞具有壹定毒性。而膽囊切除後次級膽酸增多，所產生的石膽酸經肝腸循環進入肝臟和結腸以後，會造成慢性肝損害和結腸損害，而結腸損害很可能是結腸癌的壹個原因。
2.膽結石切除膽囊的危害可能會導致膽管損傷。在膽囊切除的手術過程中，特別值得強調的是在膽管損傷的病例中絕大多數是由膽囊切除引起，膽管損傷的並發癥是膽道外科的非常疑難的課題，與內鏡“保膽取石”手術相比，內鏡保膽取石是在膽囊腔內施行手術，根本不可能傷及膽囊周圍器官;這壹點是膽囊切除的最大缺陷。
3.膽結石切除膽囊的危害會造成人體消化不良、腹脹腹瀉等反應。如果膽囊被切除，此時肝膽汁由肝內排出無處可存，不管人體是否需要，只好持續不斷的排入腸道;當進食美味家肴時，需大量膽汁幫助消化，但此時體內無“富余膽汁”相助，從而影響食物的消化和吸收，特別是影響對脂肪的消化吸收，其結果壹是誘發脂肪瀉及脂溶性維生素的缺乏等，二是造成身體遭受消化不良、腹脹腹瀉的痛苦。
4.膽結石切除膽囊的危害可能會引發堿性反流性胃炎。正常人進食後膽囊收縮使膽汁集中大量進入腸道。這壹過程與胃十二指腸的分泌及蠕動是有規律地同步進行的。膽囊切除後膽汁持續進入腸道而又缺乏食物和胃酸的中和，膽汁可在十二指腸內淤積而逆流入胃，使胃內PH值升高，細菌繁殖，而使胃粘膜充血、水腫、脆性增加，胃腺體萎縮及潰瘍形成。
如果條件合適建議膽結石患者采用微創保膽取石手術治療膽結石，北京武警三院外壹科微創保膽取石手術治療膽結石的優勢：
1.創傷下，只需在腹壁做4個指尖大小的操作孔，即可完成整個手術操作，避免了剖腹手術的創傷。
2.手術所需的剖腹擴大手術視野，使剖腹手術的盲區完全暴露在術野中，避免了損傷臨近臟器，對腫瘤的清掃更徹底，可降低復發。
3.術中應用超聲刀分離止血，出血量明顯減少，剖腹術壹般出血量約200-500毫升，而腹腔鏡壹般50毫升左右。
4.由於不需要開腹，避免了腹腔臟器長期暴露，減少了液體丟失和滲出。
5.無切口出血、感染、裂開及切口疝等切口並發癥。
6.明顯減輕剖腹術所引起的腸粘連。
7.避免剖腹術後，病人因怕引起傷口疼痛而不敢咳嗽，進而造成肺部感染。病人腹壁創傷小，可以更早下床活動，有利於早期恢復。