在這個中心，藥品入庫、存儲、揀選、配送各環節實現了自動化作業。具有存儲容量大、日吞吐能力強、訂單處理速度快、出貨準確率高的優點。
它的建成為我國現代醫藥物流樹立了壹個新標桿，將引領國內醫藥物流向著更科學、更先進、更規範的方向發展。
九州通集團公司是我國的民營醫藥流通企業，它以醫藥商業為主，以藥品批發、醫藥物流配送、醫藥零售連鎖和醫藥電子商務為核心業務。從2000年開始，九州通集團投巨資先後在湖北、北京、河南、上海、新疆、廣東、山東、福建、江蘇、重慶十大區域中心城市建設了大型醫藥物流中心，物流配送網絡覆蓋中國市場70%。2007年全集團藥品銷售達到158億元，今年預計銷售達到200億元。
近年來，九州通集團著力進行現代醫藥物流技術的研究應用，通過與國際上知名的物流集成商進行交流，引進先進的物流技術，組建自己的物流管理信息團隊，自主開發物流管理信息系統。目前，開發的適合中國國情的物流管理信息系統LMIS系統，通過了國家科技成果鑒定，獲得自主知識產權，為九州通集團構建現代醫藥物流服務平臺創造了有利條件。從2003年開始，九州通集團開始對業務量大湖北、河南、上海等地物流中心進行建設改造，采用現代化的自動存儲、自動分揀、自動傳輸設備，和倉儲管理信息系統，提高了工作效率，降低了藥品揀選的差錯率。
2007年4月，九州通集團基於北京市的重要性及戰略地位，規劃建設北京大興現代醫藥物流中心，工程總投資1.6億元。通過壹年多時間的建設施工，北京現代醫藥物流中心勝利竣工。
北京現代醫藥物流中心總建築面積32000平方米，其中分揀中心建築面積8000平方米。安裝了高速出庫自動分揀機、高速復核分揀機、電子標簽揀選系統、手持掃描終端設備、周轉箱輸送線、雙層托盤輸送線、自動化堆垛機、和移載小車等自動化設備。
北京現代醫藥物流中心藥品儲存量達到40萬箱，日均吞吐能力達到15000箱，峰值吞吐量達到25000箱，營銷網絡覆蓋北京及周邊地區，訂單配送時間控制在24小時內，藥品出庫差錯率控制在萬分之三以內。
據權威部門指出，九州通集團北京現代醫藥物送中心的建成，結束了我國大陸地區沒有具備獨立集成規劃能力的醫藥物流企業的歷史。