1、現代中醫和古中醫在“課程”內容方面有很大區別。
古中醫主要是《易經》哲學系統指導下的理論和實踐的全息辯證醫學——天人合壹。內容涵蓋：陰陽五行八卦天幹地支五運六氣（後期加入了儒釋道經典）等。
現代中醫課程介紹如下：
（1）有傳統的治法理論和現代西醫學的解剖理論。
（2）基本上刪除了天人合壹理論，易經理論，八卦理論和傳統哲學。
（3）思想教育由《大醫精誠》之類的仁愛思想轉為馬克思主義、科學思想為指導。
2、古代中醫與現代中醫分科不同。
古代中醫的醫生基本上不分科，每個中醫都是全科（但實際執行中有分科，分科不嚴格，各朝代分法也有異。）。
現代中醫按照西醫方法分科。
3、醫生的培養方法不壹樣。
古中醫以師傅帶徒弟的方法授徒，徒如侍奉父親壹樣待師傅，絕不會因為給老師做點家務就委屈得去自行水葬了。古中醫主要是以實踐為第壹要務，以辯藥識方為第二要務，以理論學習為全程輔助，無十年之功，根本不讓妳出師。
現代中醫只能以學校教育三年，五年，最多七年的合法培養方式。沒有實踐，實踐在工作中進行，老師也基本上不懂治病。以理論為第壹要務，以中藥分析為第二要務等等，學分修夠，就給畢業，至於會不會治病，沒有要求。