目的基因能否穩定遺傳的關鍵是檢測基因表達載體的構建。顯然，在實際應用中，只有那些以足夠高的水平表達目的基因的轉基因生物才是有意義的。
如果轉基因後代分離比例不符合孟德爾遺傳規律，轉入的外源基因有可能幹擾了內源基因的表達。另壹個原因是在受體基因組中的不同位點整合了兩個或更多個轉基因拷貝。這些都要進行育種試驗確認。
擴展資料
目的基因相關的操作包括目的基因鑒定、分離、克隆、轉化及轉化後鑒定和測試等。
通常，目的基因要麽是已知供體生物基因組“文庫”的壹部分，要麽是來自於先前未研究過的供體生物基因組。無論是哪種情況，聚合酶鏈式反應（PCR）技術都可以是目的基因倍增至生成構建體所需的數百萬拷貝的水平。
當產生許多拷貝的目的基因後，可以通過酶切反應（或gataway系統），將目的基因酶促連接到構建載體中，然後將整個構建在細菌中表達，從報告基因選取陽性轉化體，通常涉及含有插入DNA的菌落中的壹些顏色變化。挑取陽性菌落，做液體培養，提取質粒DNA，進行酶切，切膠純合。獲得的DNA可用於後續的轉化。