1．煤
煤的開采會導致地面下沈（地下開采）和地表破壞（露天開采），汙染和破壞地下蓄水層，產生粉煤灰等大量固體廢棄物，侵占土地。煤炭運輸過程中還不可避免地排放粉塵，汙染當地大氣。最嚴重的是煤炭燃燒所致的大氣汙染，無論是發電用煤還是工業終端用煤，都將向大氣中排放二氧化碳、二氧化硫和煙塵等有害物質。煤炭燃燒是溫室氣體二氧化碳的最大來源。按單位有效能所排放的大氣汙染物計算，煤炭是對環境危害最嚴重的化石燃料。
2．石油和天然氣
石油和天然氣的開采對環境的影響與開采方式有關。陸上油氣開采會導致土地破壞、地下水汙染，海上油氣開采會影響漁業和海洋生物環境，兩者都會排放液態和固態廢物。石油在生產、儲存、運輸過程中如果發生泄漏，將會對環境造成較大的影響。石油和天然氣也同屬化石礦物燃料，燃燒時都會向大氣中排放碳，但因不同礦物燃料的含碳量不同，燃用同量的煤、石油和天然氣，各自排放的二氧化碳量也不同，燃石油較燃煤少30%，燃天然氣則較燃煤少50%，故燃天然氣相對比較清潔。
3．水電
水電是壹種潔凈的二次能源，但在大型水電工程的建設過程中，仍會對環境產生影響。修建水庫會淹沒大片土地，吞沒森林，損害動植物物種，需要大規模安置移民。大壩會擾亂河流的自然流量，造成河床破壞，傷害水中生態系統，幹擾魚類和其他水生動物的產卵和遷徙方式，也將引起濕度變化和降雨等氣候變化。
4．生物質能
生物質燃料是壹種傳統能源，也是許多國家農村的主要能源。生物質燃燒會產生大量煙塵，造成區域性大氣汙染；過度消耗薪柴，會使植被遭到破壞，加劇森林的退化，加大“溫室效應”的壓力。大量使用稭稈和畜糞代替薪柴，會導致稭稈不能還田，使土壤有機質減少，肥力降低，生態環境惡化。
5．核能
核能對環境的影響具有很大的不確定性，鈾礦的開采與加工、燃料循環與發電、核廢料與廢棄核電站的處置，其中每壹個環節都有可能向周圍環境泄漏有毒或放射性物質。盡管核事故發生的概率很低，核能的安全性不比其他能源差，與化石燃料相比，對環境的損害也較小，但公眾對核安全的憂慮仍是核能發展的壹大障礙，所以評估核能對環境的影響是比較困難的。
6．太陽能、風能、地熱和潮汐能
太陽能、風能、地熱和潮汐能都是可再生能源，對環境影響較小。地熱對環境的不利影響包括排放二氧化碳等氣體、汙染地下水、廢棄地熱井的地面塌陷等；太陽能的大規模利用需占用大片土地；潮汐電站的設計中要考慮海洋魚類的生態環境問題。但這些新能源同屬清潔能源，它們的大量開發利用，有利於改善環境狀況。
綜上所述，礦物能源傳統的開發利用方式需要付出巨大的環境代價，對溫室效應貢獻突出，其中尤以燃煤帶來的危害最大。積極尋求各種替代礦物燃料的清潔能源，如發展水電、核電及各類新能源，以改善能源結構，減輕環境汙染，勢在必行。鑒於礦物燃料在近期內仍將作為能源結構中的重要組成部分，不斷研究應用礦物燃料，開發利用更為合理的新技術，以緩解環境危機是十分必要的。