蓮花的別稱有荷花、芙蕖、溪客、碧環、玉環、鞭蓉、水芙蓉、鞭蕖、菡萏（未開的花蕾稱菡萏，已開的花朵稱鞭蕖）、水芝、水華、水蕓、水旦等。
芙蓉 《爾雅》：“荷，芙蕖，別名芙蓉，亦作夫容。”《說文》：“芙蓉花未發為菡萏，已發未為夫容。”李時珍《本草綱目 》：“芙蓉，敷布容艷之意。”
芙蕖 《爾雅?釋草》：“荷、芙 蕖。……其華菡萏，其實蓮，其根藕。”疏：“皆分別蓮莖、葉、華、實之名。芙蕖，未發為菡萏。”魏曹植《洛神賦》：“迫而察之，灼灼芙蕖出綠波。”晉潘嶽《蓮花賦》：“遊莫美於春臺，華莫盛於芙蕖。”
藕花 唐張籍《送從弟之蘇州》詩：“夜月紅柑樹，秋風白藕花。”宋陸遊《同何元立賞荷 花追憶鏡湖舊遊》：“三更畫船穿藕花，花為四壁船為家。”
水芙蓉 《群芳譜》：“荷花亦稱作芙蕖、水芙蓉。”因木本拒霜花花艷如荷花，故有“芙蓉”、“木蓮”之稱，為明其區別，故又稱荷花為水芙蓉。
草芙蓉 《廣群芳譜》“荷花：芙蕖花，壹名水芙蓉。”註雲：“杜詩註雲：產於陸者曰木芙蓉，產於水者曰草芙蓉。”
水華 李時珍《本草綱目》：“蓮花”釋名：“芙蓉、芙蕖、水華。”
水芝 普崔豹《古今註》下“草木”：“芙蓉壹名荷華，壹名水目，壹名水芝，壹名水花。”《本草綱目》：“《本經》謂蓮子為"水芝丹"。”金元好問《泛舟大明湖》：“晚涼壹棹東城渡，水暗荷深若無路。江妃不惜水芝香，狼藉秋風與秋露。”
澤芝 《類聚》引晉郭璞《爾雅圖贊 ?芙蓉贊 》雲：“芙蓉麗草，壹曰澤芝，……”劉宋鮑照《芙蓉賦》：“訪群英之艷絕，標高名於澤芝。”
靈草 魏曹植《芙蓉賦》：“覽百卉之英茂，無斯華之獨靈。”吳閔鴻《芙蓉賦並序》：“乃有芙蓉靈草，栽育中川。”
玉芝 《本草經》載：“荷花又名玉芝。”
君子花 北宋周敦頤著《愛蓮說》，謂蓮為花中之君子，故蓮又稱“君子花”。黃宅中《希濂堂留詩》：“是時夏六月，蓮沼吐芳芬，我愛君子花，遺花如甘棠。”
水宮仙子 因蓮生水中，蓮花亭亭玉立於水面，好似仙女飄然而行，故名。宋張耒《雞叫子?荷花》：“平地碧玉秋波瑩，綠雲擁扇輕搖柄，水宮仙子鬥紅妝，輕步潛波踏明鏡。”
凈友 又稱凈客。蓮花潔凈不染，因此人們稱其為凈友。唐代孟浩然《大禹寺主公禪詩》：“看取蓮花凈，方知不染心。”宋代陳亮《新荷葉》詞：“艷態還幽，誰能潔凈爭研。”宋代劉過《賀新郎》詞：“水浴芙蓉凈。”
菡萏 即蓮花，或指未開之蓮花。《爾雅》：“荷，芙蕖……其華菡萏。”唐代劉商《詠雙開蓮花》：“菡萏新花曉並開，濃妝美笑面相隈。”明李夢陽《去婦詞》：“菡萏鴛鴦不羨，人生壹別何由見。”