1、浸泡。金剛菩提子紋路多而深，需要仔細清潔。清潔之前要先進行浸泡，將金剛菩提放入開水（春夏季）或溫水（秋冬季）中浸泡幾個小時，軟化金剛菩提表面殘留的果肉。
2、粗刷。金剛菩提浸泡幾個小時後，可以取出菩提子進行粗刷。粗刷時，用鋼絲刷以垂直角度平刷，使珠子轉動起來，確保每個角落都刷到。鋼絲刷上的鋼絲硬度高而細密，即使是幹硬的殘余果肉也可以刮掉。刷完後，把金剛再放回水中，用手使勁攪動，將渣滓洗出來。
3、密封靜置。菩提子刷完後，將其放入密封袋中密封壹夜，註意壹定要封口。其目的是繼續軟化粗刷後殘留在皮殼上的果肉和毛屑。次日再從密封袋中取出處於半陰幹狀態的金剛菩提。
4、細刷。將半幹的金剛菩提子用硬毛刷逐顆仔細清理，直至完全清理幹凈為止。如果還需要入水清潔，則需要把從水裏取出的金剛菩提放到壹塊幹布上包裹起來，用手隔著布輕輕搓壹搓，把大部分水甩到或揉到布上，反復幾次，充分吸收菩提子表面的多余水分。
5、陰幹。將經過細刷後的金剛菩提子再次放入袋子中陰幹，密封袋為半開狀態，直到所有金剛菩提自然幹即可。陰幹期間切忌將其置於大風中，不可暴曬，不能放在空調冷暖氣附近。會使金剛菩提水分流失不均而導致其快速開裂。
擴展資料：
盤玩金剛菩提需要註意：
1、金剛菩提的把玩類似於文玩核桃和橄欖子，講究“三分盤七分刷”。“盤”的目的是上色，“刷”的目的是形成包漿和實時清理。可以用刷子刷金剛菩提，刷子顧及不到的位置可以用針挑，壹定要小心細致，不可傷害“齒”。
2、盤玩金剛菩提時要註意手部清潔，不宜有汙漬。註意手部清潔衛生，有利於把玩出壹個色澤油潤、幹凈漂亮的收藏級金剛菩提。