中國古代的書肆，又稱書坊、書鋪，是集搜集、銷售和刻印、出版圖書為壹體的店鋪。文奎堂就是壹家以刻印、出售古、舊書籍為業的百年老字號書肆。文奎堂始建於清朝光緒七年(1881年)，創建人王雲端，字輯五，河北束鹿人。文奎堂原址在東城區隆福寺街路南。它以歷史悠久，藏書豐富，旺銷旺購而聞名於京城。
自清朝乾隆年間編撰《四庫全書》開始，宣南地區雲集了大量來自全國各地的文人墨客，由於來往的文人眾多，便逐漸形成了以琉璃廠為中心的文化市場。
文化市場的形成致使琉璃廠周圍的書肆大量湧現，同時，在琉璃廠還有經營各種字畫、古玩、文房四寶等商品的店鋪。
這種眾多文化的融合和眾多商家林立在這裏，吸引了全國各地的文人學者來這裏觀賞，或購買書籍。當時，《四庫全書》的主修官大學士紀曉嵐，以及《四庫全書》的其他編修官員，也經常到琉璃廠搜集和查閱壹些珍貴的文獻典籍。
王雲端就是在這種激烈的競爭環境下，進入京城圖書市場，開始了自己的創業和經營的。他深深地明白，只有樹立自己的品牌，才能開辟出屬於自己的天地。
據史料記載，福隆寺街，舊書店的歷史最早，書肆最多，但藏書最多的只有文奎堂、修綆堂、修文堂等寥寥兩三家。文奎堂的藏書，除了在書肆上收購之外，還大量搜集和購買名人藏書，其中還購買了清朝最後壹位皇帝溥儀的大量藏書。
1925年，文奎堂與待求書社、晉華書局合夥購進徐梧生的大量珍貴藏書，其中包括宋版的《史記》、《晉載記》、明初補本的元刊《玉海》，明朝正德刊本《百川學海》、錫山安氏活字本《顏魯公集》、元俞和手抄本《琴史》、明藍格舊抄本《太平禦覽》、《文苑英華》、《古今歲時雜詠》，紀昀批校本《李義山詩集》、初印精刻本《言刃庵集古印本》、《經義考》、《助字辨略》等珍稀版本書籍。由於擁有大量的古珍本、絕版書籍，吸引了大批的文人學士，致使其生意日漸興旺。
除收藏書籍外，文奎堂還經常印新書出售。文奎堂印制的書籍很多，主要有：清青浦吳廣成撰寫的《西夏書事》、清富察敦崇撰寫的北京歷史風俗文化方面的《燕京歲時記》、清雲間徐子室編輯的中國古典戲劇方面的《南曲九宮正始》等。這些印制的書籍，都具有很高的學術價值。
這些書籍的出版受到了社會各界的喜愛，同時，也使更多的人也認識了文奎堂，它的名氣逐漸傳遍了京城。"內外城書肆，文奎閣為冠"足以顯示出它當時的勢力。
王雲端去世後，他的兒子王金昌繼任文奎堂老板。王金昌遵從父親的遺願，繼續經營文奎堂。此時印書、售書的店鋪已大都轉移至琉璃廠壹帶，也就是說琉璃廠已主導了京城內的文化銷售市場，隆福寺文化市場開始蕭條，文奎堂的生意也日漸衰落。
新中國成立後，政府對北京的書肆業和琉璃廠文化街進行了整頓和調整，文奎堂遂由隆福寺街遷到西琉璃廠，重新建店營業。