118 ——被海浪連續殺死
服部平次邀請柯南、毛利和小蘭訪問大阪。旅途中，壹群人遇到了離奇的墜樓身亡。這和之前的殺人案驚人的相似，有連環殺人的嫌疑。柯南和平治仔細推敲案情後，發現整個案件都指向壹段女性關系，但就在這時她沈默了，案件變得越來越危險。
166-鳥取蜘蛛屋的怪物(事件)
和女友葉受委托去鳥取縣木偶嶺武田的家，卻在路上迷了路，遇到了壹個叫的外國人。此時，同樣被武田家請來解決傀儡嶺蜘蛛屋之謎的柯南等人正好路過。他們到達的當天晚上，武田的大兒子新壹在傀儡倉庫二樓上吊自殺，隨後葉身後出現可疑人物。
167-鳥取蜘蛛屋的怪物(懷疑)
而葉也被帶走，消失了。與此同時，柯南、服部哲和小五郎正在調查新壹的死亡現場。期間，丫鬟燕姑送了他們壹夜，並告訴他們三年前發生的事情。當我們得知葉禾被帶走時，我們分頭尋找，終於在倉庫裏找到了葉禾，但幸運的是，我們的生命沒有受到威脅。之後，柯南和找到了襲擊者和葉時使用的電棍和BB彈，並再次返回案發現場尋找新的線索。兇手就是那個人。沒錯！
168-鳥取蜘蛛屋的怪物(解)
服部哲叫上武田的家人和羅布來到倉庫二樓的謀殺現場。柯南麻醉了小五郎，在黑暗中揭露了兇手使用的手法。當被問及兇手是如何在這個形似密室的倉庫中作案時，柯南的回答是兇手根本沒有出現在殺人現場，那麽兇手是如何作案的呢？新壹為什麽虐待他的女兒美紗？美紗自殺的真正原因是什麽？是什麽樣的誤會導致武田家悲劇頻發？
190-危急生命的復活？第三種選擇
阿沙拉這麽做的目的是提醒柯南，表白是有風險的，讓他慎重考慮，擺在他面前的是三個選擇。柯南會如何選擇？另壹方面，迪丹高中遊園會當天，該劇在體育場上演時，觀眾席上發生了壹起命案。這時，壹個年輕的粉絲突然出現了。當他脫帽隱藏身份時，在場的人都驚呆了。很久沒有出現的工藤新壹會在這裏出現。然而，葉禾暴露了這個家夥的真實身份。
191-危急生命的復活？黑色騎士
雖然勘查了現場，但警方無論如何也找不到決定性的證據。當他們束手無策時，小五郎提出了他的自殺理論，並得到了警官牧牧的認可。就在警察準備自殺結案的時候，劇中的黑騎士突然出現了。否定了自殺論後，他摘下了面具，面具下是那張讓小蘭如此思念的臉。是的，真正的工藤新壹出現了，並有精彩的表演。
192-危急生命的復活？新壹回來了。
沒想到足原準備的解藥可以長時間維持這個放大的身體，而能和新壹同時出現在小蘭面前的柯南，居然被足原偽裝了，從而徹底打消了小蘭的懷疑。後來，新壹邀請小蘭到米花中央大廈的瞭望餐廳吃飯，想借此機會表明心意。然而就在這時發生了壹件命案，新壹暫時離開小蘭去破案，並成功斷定兇手就是大昌先生。
221 ——充滿謊言的客戶(下)
神秘女子赤波女士尋找的中學同學柴田手裏拿著照片被殺，小五郎等人開始審問相關人士，柯南也明白了柴田拿著照片的意思。《沈睡的小五郎》公開揭穿了赤波女士的諸多謊言，卻判定兇手另有其人。兇手留下的鐵證留在了罪犯手裏。在鐵證面前，罪犯終於承認了罪行，但在罪犯準備自殺時被池伯制止，池伯女士的身份終於被揭露。
222-失蹤的美人魚(事件)
服部哲收到了壹封奇怪的委托信，於是他們壹行人來到了美洲島。沒想到這封信的寄信人沙智三天前就不見了。當晚，島上熱烈慶祝壹年壹度的儒艮慶典。據說有個長壽的女人吃過人魚。凡是得到她所詛咒的儒艮之箭的人，都可以實現長生不老的夢想，但是在慶祝的時候，沙之的朋友壽美卻意外的。
223-失蹤的美人魚(推論)
死者是直子。柯南和服部哲在犯罪現場發現了魚鱗和腳印，但是腳印的方向通向大海。僅憑這些零星的線索是不可能抓住兇手的。這時惠鈞說她有今年節日購買的號牌清單，於是柯南壹行人去了神社，悲劇再次發生。惠鈞在尋找名單時死於倉庫火災。之後，柯南和服采取了行動，服部哲發現了新的線索。偏偏柯南在這個時候打來電話。他推斷出了什麽樣的真相並讓服部哲吃驚？上山找門的時候，而葉偉救下了掉下懸崖的衣物，她能化險為夷嗎？
224-失蹤的美人魚(解)
柯南麻醉了小五郎，召集了島上的所有人，準備將真相公之於眾，但是沒有葉海亞和服部哲的蹤影。在警察的催促下，柯南不得不開始對整個案件進行推理。雖然門邊和魯朗最有可能作案，但柯南首先排除了他們的嫌疑。當他指出真正的兇手時，在場的每個人都震驚了。這時，自救成功的服部哲及時趕到推理現場，甚至出言不遜。
238 ——大阪三大K事件(上)
在服部哲的邀請下，小五郎、小蘭和柯南去大阪參加壹個名為“3K餐廳”的開幕酒會。這家餐廳的主人是前職業拳擊手裏卡多·雷、美國職業棒球投手邁克·諾德和柯南的偶像職業足球運動員雷·卡迪茲。沒想到，就在柯南等人幫他們制定秘密計劃的時候，槍聲突然響起。柯南和服部哲趕到發生槍聲的房間，發現美國報紙記者埃德·麥肯在房間裏被槍殺。警察立即告訴所有的人。
239——大阪三大K事件(下)
在收集線索時，柯南沒有像以前那樣提出許多問題，而是盡力反駁服部哲的推測。後來，他們在壹個房間裏發現了壹個不該出現在這裏的拖把。有了這樣的東西，兇手的作案手法被徹底破解了，但是柯南還是不甘心自己的猜測，所以他想找證據推翻自己的想法。然而事與願違，他越是鉆研事情，就越會往自己不願意承認的方向發展。
263 ——大阪的雙重神秘劍客與太閣城
葉和帶著小蘭去了大阪。他們都是豐臣秀吉的崇拜者，所以每個人在團隊中扮演不同的角色，但柯南等人沒有看到“豐臣秀吉”。然而沒過多久，就有壹個人從滿身是火的天壽閣上掉了下來，死了。這個人就是旅行團中的“豐臣秀吉”。服部哲和柯南在屍體周圍發現了碎片和卷軸。這時，葉說，這和十三年前發生的焚屍案是壹樣的。盡管沒有任何線索，柯南和服部哲斷定這壹定與豐臣秀吉的寶藏有關。當柯南和服部哲正在調查時，小蘭和葉禾目睹了壹起謀殺案。死者是壹個旅行團裏的壹片桐。服部哲只是想仔細調查，但他被父親教訓了壹頓。但這激起了服部哲調查真相的欲望。柯南和服部哲根據手頭的線索和嫌疑人的口供推斷出了兇手，於是他們偷偷跟著爛房子來到了壹個破舊的工廠。然而螳螂捕蟬黃雀在後，柯南卻默默無聞。服部哲能成功找到兇手嗎？
291 ——海島公主與龍宮城(事件)
電視臺邀請小五郎和服部哲來沖繩舉行東西方推理比賽。之後，大家和電視臺工作人員壹起乘船前往發現不明男子屍體和奇怪文字的無人島。當他們檢查完畢準備返回時，在海灘上發現了被不明人士殺害的工作人員之壹梁平小姐，並在她身旁留下了壹句令人不快的話。正當服部哲和柯南在推理的時候，送他們的船和船長也消失了。
292 ——海島龍宮城公主(追求)
我們不能渡海，只能暫時待在市長家的廢棄別墅裏。但是，坐在這裏等待救援還不如調查房子，所以呢？每個人都分組行動。柯南和服部哲等人在壹樓房間的橫梁上發現了市長和他女兒的照片以及壹些令人費解的文字。突然，二樓傳來壹聲尖叫。Kumi在看到市長女兒的肖像油畫後不知何故變得異常。這時，壹艘救援船趕到了，但船上只有壹具船長的屍體和壹行字，事情越來越奇怪。
293 ——海島公主與龍宮城(解)
當葉和在廚房找食物時，柯南和也出現了，他們在椅子下發現了奇怪的名字。他們絞盡腦汁想破解這句話的含義，可柯南和卻被葉無意中的壹句話給啟發了。他們雖然知道兇手是誰，卻找不到決定性的證據，於是給兇手設下陷阱，壹切按計劃進行。兇手做了壹些事，但是他做了。
323-服部平次不知所措(第壹部分)
平治和葉子原定要來柯南，但是柯南沒有在預定的時間出現。他們很擔心。小蘭突然想起服部哲說過他要見壹個叫南川的偵探。不久，柯南和其他人在南川的公寓裏找到了線索，並去了律師伊藤美佐裏的家。然而，伊藤聲稱平治對他們壹無所知。但此時服部哲和葉正被鎖在他家的屋頂上。原來伊藤的目的是用偷稅漏稅的證據，迫使平次解開銀行保險櫃的密碼。平治和葉正能逃脫嗎？
324——服部平次不知所措(下)
平治和被惡毒的律師美裏、大馬沙關了起來，被迫解開偵探南川留下的壹個暗號。另壹方面，柯南因為找不到他們的下落，找了壹家餐廳吃午飯。突然平治打了個電話，請求幫助破譯暗號，但是柯南發現了暗號的異常。此時也為美裏、大馬沙解開了暗號之謎，柯南也成功解開了謎題並報警救出了平姬和。
325-火焰中的紅馬(事件)
平治，葉終於安全抵達小五郎的辦公室。吃飯的時候，五個人說最近發生了壹系列的火災事件，總有壹個紅馬娃娃留在現場。第二天，柯南等人參觀了委托給他們的房子後，亮子也放棄了委托，理由是他可能會起疑心。在柯南的監控過程中，他們遇到了風水師曾和的矛盾。就在柯南回去後，又發生了壹場火災，地點是亮子的住所。
326-火焰中的紅馬(搜索)
柯南等人對警視廳連續火災現場留下的紅馬照片進行了驗證，發現其中1立刻出現了“兔”字，由此得出結論“紅馬”就是出現在《三國誌》中的赤兔馬。另壹方面，古董店經理隆德·田璇參觀了住腳屋。因為他打算送給豬腳亮子的雕像是騎著赤兔馬的關羽，田璇的名字引起了搜索隊的註意。經過壹系列的調查，田璇被逮捕，但柯南和黑治發現了不同之處。終於，在柯南和平的共同調查下，犯人的真面目慢慢浮出水面。
327-火焰中的紅馬(解決方案)
翟承認他是壹名囚犯。柯南、平治和弓長警部在田璇的房子裏發現了壹個竊聽器。從亮子雙手緊緊抓住的座墊上找到了更有力的物證。在向曾軼可的丈夫朱嬌明和權騰的兒子報告搜尋結果後的當天晚上，三個神秘人物出現在的家中，兇手和縱火犯的真面目終於被揭開。兇手利用連環縱火殺害了亮子。
381-誰的推理說明(第壹部分)
服部平次和遠山和葉專程趕到東京，邀請柯南和小蘭到大阪觀看甲子園球賽和包祖卡歌舞。可惜這兩個節目居然在同壹天舉行。為了決定看什麽，服部哲和葉禾爭論不休。這時，小五郎提出了壹個決定去向的推理比賽。他委托警方調查壹起謀殺案，並把它交給了平治和葉禾。本案中的死者是壹家玩具公司的總裁。服部哲準確地說出了死亡方式和案發現場的兇器，還用積木找到了死者留下的死亡留言，而葉欣不甘又認真地參與了密碼的破解。這兩個人誰更厲害？
382-誰的推理秀(第壹部分)
我不忍心看到葉禾為死亡的消息而焦急地哭泣，所以服部哲在與柯南的對話中故意透露了壹些小技巧。幸運的是，葉禾明確表示。另壹方面，警方把最先發現屍體的4人叫來，逐壹進行詢問。他們發現每個人都有不可告人的殺人動機，柯南和服部哲沒有停止尋找真正的兇手。就在他們發現新線索的時候，何葉突然大喊他們知道兇手是誰了。
383-甲子園的奇跡絕不能輸給看不見的魔鬼。
緊張的氣氛不僅圍繞著球場，正在尋找另壹部寫有其他線索的手機的警官柯南、服部哲和大龍也在絞盡腦汁破解暗號。柯南還特意借了小五郎的收音機，方便了解球場上的情況。幸運的是，當第二部手機響起時，服部哲成功地找到了它，但接下來等待他們的是另壹組令人費解的數字。三人商量後決定分頭行動，雖然最後還是找到了第三部手機。但是，裏面只剩下壹個括號和數字13。柯南和服部哲能解開這個與前兩次不同的數字代碼嗎？柯南和服部哲必須在第九局後半段之前解開密碼，但時間不多了。這個空白的密碼到底代表了什麽？這時候柯南恍然大悟，想起了看臺上失蹤的大門17和22，但是情況危急，必須爭分奪秒。之後，服部哲和柯南推斷出暗號所指的座位，但它不在小蘭附近，他們沒有到達。他們三個爭先恐後地尋找第壹名。
406 ——柯南和黑姬的推理魔法(操控)
小蘭、柯南、服部哲、葉禾壹行去看了魔術師星河吳彤的奇幻魔術表演。逃出水面時，葉禾和小蘭以為魔術失敗，沖到舞臺上救人，卻沒想到這只是壹場制造舞臺效果的表演。於是，葉、來到後臺，見了範天、濟公。原來他們都是十年前失蹤的魔術師嬴政的弟子。後來，他們四個人被邀請到嬴政的家裏，但是在這短短的時間裏發生了壹件謀殺案。
407 ——柯南和黑姬(大廈)的推理魔法
嬴政的三個弟子之壹濟公被殺後，警察趕到現場調查並審問了房間裏的每壹個人。嬴政的妻子李曼夫人說，在翻箱倒櫃的資料室裏有壹個筆記本記錄了嬴政自己的魔法，壹個戴著帽子和墨鏡的人五年前就找過嬴政，所以嬴政房間裏的每個人都希望從他的相冊裏找到這個可疑的人，柯南和服部哲也在這裏有了新的發現。這時，而且
408 ——柯南和黑吉的推理魔法(解)
葉和小蘭說，停電前和通話後，他們看到的花瓶影子差別很大。在這麽短的時間內，月球真的會移動得這麽快嗎？後來，牧牧警官調查了當時範田的休息室，但沒有發現任何可疑之處。就在他要關窗離開的時候，柯南和服部哲看到了映在窗戶上的影子，不禁恍然大悟，沒錯，兇手就在這個房間裏。
479 ——和服部平次在壹起的三天
當服部哲和葉禾帶著柯南來到東京賞櫻時，壹個來自盛月寺的小和尚突然找到了小五郎，讓他調查壹件奇怪的事情。他說，幾天前，寺廟的壹位女施主腹部被刺，倒在另壹個大廳裏，到處都是血，但當他打電話給師父和警察時，房間裏空無壹人。於是，柯南、服部哲等人壹起去調查，除了在房子裏發現了耳環，沒有其他線索。就在他們離開之前，小和尚說了很久，屋裏有壹具女屍，但是柯南趕到的時候，什麽都沒有。這壹切都是長久以來的幻覺嗎？而葉的風車給了壹個暗示。同時柯南也知道了房子上血的方法和屍體的消失。在否認了小五郎異想天開的猜測後，服部哲說出了真相，並指出背後操作的人是住持的長期大師。然而，他這樣做的目的是什麽？聖嶽廟的案子了結後，小五郎連夜開車回了住處。第二天，服部哲要去參加日商電視臺在壹個無人島舉辦的高中生推理競賽。柯南也和他壹起去了，但是我沒想到會在這裏遇見白馬探！東西南北四位代表簡單介紹後，各自回房休息。吃飯的時候，他們發現局長被綁在密室的房間裏。幸運的是，他的生命沒有受到威脅。就在大家忙著尋找線索的時候，照顧他們日常生活的佳谷突然說，這是比賽的第壹個問題。北境代表答應過水七規壹小時後重現密室技術。在等待期間，南方代表石金潤在談到壹年前的薰衣草被殺事件。時間壹點壹點過去，月水卻沒有出現。當所有人到達時，他已經死在密室裏了。
490-服部平次對工藤新壹？滑雪場的推理對抗
平治和柯南通電話的時候，聊到了壹個初中沒見過的仇人。當時平治和同學來山裏滑雪，不想遇上壹起命案。死者是著名演員吉倫獎士兵。這個案件與四年前這裏發生的謀殺案非常相似。遇難者都死在纜車上，身邊的背包裏全是雪。在調查的過程中，服部哲總是從別人口中聽到壹個同樣參與破案的初中生，而這個人就是工藤新壹，服部哲不禁與這個“看不見”的對手較勁。隨著調查的深入，服部哲和新壹可能都知道了兇手和他的作案手法。盡管他們都想超過對方，但仍有壹些疑問沒有解決。這時，廣子告訴了新壹另壹個版本的雪女故事，服部哲也從父親那裏得到了靈感。天快黑了，正在接受訊問的嫌疑人已經坐立不安了。服部哲沖進小屋，把案情的來龍去脈壹壹講述。幾乎與此同時，新壹也在電話中向警方說出了真相。
林峰火山？迷宮的裝甲戰士
小五郎、蘭、柯南壹行受武田直樹委托，調查兒子壹郎離奇死亡事件。與此同時，服部哲調查了武田死敵衛龍家中兒子康四的死因。和壹郎壹樣，康絲的屍體旁邊也放了壹條死蜈蚣。那壹夜，呵呵葉和小蘭看到了身披鎧甲的敗軍武士的影子。得知此事後，衛龍家的淩華神大驚失色地跑了出來。當她被發現時，她已經被吊死在壹棵樹上，壹只死蜈蚣也出現在她的腳邊。
林峰火山？陰與閃電的終結
康斯、易朗和淩華有壹個共同點，那就是他們都曾經和阿靜壹起無數次地挖過武田信玄的秘密金山。後來，柯南和服部哲去衛龍家查看武田信玄的盔甲時，碰巧看到了他常用的軍事策略“林峰火山”，恰逢康四、易朗、淩華之死。所以，可以推斷，兇手接下來可能要把火對準火刑柱。就在這時，他打來電話，說有人掉進火裏了，這個人無數次。警方在犯罪現場發現了壹個筆記本，是移動日記本的形式，上面寫著四名死者殺害賈飛先生的秘密。根據這個筆記本，大和警署的警員推測兇手犯有多次殺人罪。但還是有壹些疑點，於是柯南和服部哲再次來到淩華的死亡現場，從壹名警察那裏聽到了關鍵線索，兇手是…
521-兇手-工藤新壹
工藤收到了後藤明仁的來信，稱他壹年前處理的案件存在錯誤，要求他重新調查。於是，在服部哲、小五郎等人的陪同下，他們壹起去了那個村子。柯南壹個人來到信中提到的地址，不想被關在小屋裏。就在這時，他的身體因為誤食解藥而開始發生變化，在逃跑過程中掉進了附近的湖裏。當他被發現時，他已經失去了記憶。為了讓他想起過去，服部哲壹行人帶著新人來到當時的案發現場日原村長的家裏，見到了河內的記者李紳和武田誠仁的同學水川夢生。雖然沒有找到什麽關鍵線索，但小五郎等人還是從當地人口中得知了亡羅神的傳說。難道這就是所有死去的羅神的懲罰？第二天壹早，新壹壹個人去了日源的村長家。當服部哲到達時，他看到新壹渾身是血地站在記者旁邊。他確信兇手壹定不是新壹，於是在警察趕到前把他藏在後備箱裏，並特意叮囑小蘭、葉禾等人去忽悠警察壹會兒，不料小蘭突然跑進了森林...
522 ——新壹的真實身份與蘭的眼淚
小蘭從昏迷中醒來，發現自己躺在壹個小木屋裏，身上的傷都包紮好了。這時，小五郎等人也發現了這裏。服部哲在隔壁房間發現了許多新線索。重新整理案情後，他把大家叫到村長家，指出用刀捅他的人就是他旁邊的工藤新壹。沒想到，被揭穿後，新壹竟然淚流滿面，主動承認了自己的罪行。死去的羅神和相互呼應，壹起揭穿了假新壹的身份，又向大家說明了村長夫婦被殺的案情，而這個死去的羅神自然就是本人了。案子結束後，心怡的身體又變了。多虧了足原的及時到來，新壹才保住了秘密不被發現。在回家的路上，壹輛汽車在路上危險地行駛。當大家試圖阻止時，發現司機已經被勒死。
523-我真正想問的是
根據死者的余溫，新壹和服部哲斷定兇手就在附近。他們借用偶然認識的高木警官的力量封鎖了收費站，很快就把犯人鎖定在三個人身上。後來，他們在死者的窗戶上發現了兩個小洞，這無疑是找出兇手的關鍵線索。然而，阿沙拉給新壹的藥快要過期了。新壹該怎麽辦？小蘭壹直想告訴他什麽？
554 ——鸛的探索之旅(蘭搜索)
為了讓扭傷了腳的柯南好好休養腳傷，大家壹起來到承起溫泉。可是，小蘭突然不見了。柯南從嚴光和他們拍攝的照片中看到小蘭帶著壹個小女孩，照片中出現了壹個行蹤可疑的男子。就在這個時候，柯南和他的家人遇到了服部哲，他受托尋找壹個名叫蔡陽的女孩，她就是小蘭的孩子。據蔡陽的父親周平說，當蔡陽失蹤時，他藝術博物館裏的展品彩虹之子也失蹤了。正當大家四處張望時，蔡陽和小藍遇到了危險。
555 ——鸛的探索之旅(楊美食追蹤)
從昏迷中醒來的蔡陽趁父母爭吵時偷偷溜出醫院，按照歹徒的指示去找彩虹之子。這壹切都在柯南的預料範圍內。他讓服部哲秘密追蹤它。期間，小蘭用撿到的布美徽章聯系少年偵緝隊，並暗示了自己的位置。雖然歹徒找到了服部哲等人，柯南還是找到了蔡陽和歹徒要去的地方。見勢不妙，想要逃跑的小蘭被救了出來。
573-害羞護身符的下落(第壹部分)
服部哲誤將葉禾的護身符給了郭美照明。為了拿回有服部哲照片的護身符，他們去了東京。他們在國家的盡頭找到了壹個朋友，跟著他去了壹家體育咖啡館。他們不想讓末日國度被打得不省人事，昏迷在廁所裏。於是柯南、服部哲和高木警官壹起展開了調查。他們把嫌疑人的範圍縮小到三個人，推斷他在國尾白天看的比賽和這個事件密切相關，但是他看的是什麽比賽呢？這三名嫌疑人的證詞中隱藏著什麽線索？
574-害羞護身符的下落(下)
因為警方沒有從郭敏身上找到相關球票，所以無法判斷他觀看的比賽內容。就在三名嫌疑人吵著要回去的時候，柯南和服部哲說他們已經知道兇手是誰了，但是苦於沒有證據。這時候電視上體育賽事的轉播給了他們壹個暗示，兇手就是他！案子結束後，大家都去醫院看望覺醒的國家。在此期間，警方將葉禾的護身符交給了服部哲，而當服部哲得知葉禾是秘密的時候會有怎樣的反應？
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劇場版:
電影3-世紀末的魔術師
電影7-迷宮的十字路口
電影10-警探的靈魂之歌
電影13-黑暗追蹤
電影14-天空中的海難
OVA:
ova 1-柯南VS基德VS阿健！包道為大戰役而戰(柯南的夢變成了黑姬)
Ova2-16嫌疑人
OVA3——柯南和平吉與消失的少年
OVA 6-追蹤丟失的鉆石！柯南和平治vsKID！
ova 9-十年後的陌生人(柯南夢見10年後接受記者采訪，更有意思也算)。
特別版:
m 10-感恩節10周年！！柯南獎頒獎典禮
m 14-特別版-通往大阪什錦煎餅的艱難之路