圖書館中的水平和垂直通道將各種房間有機地結合在壹起。通過科學安排采編、倉儲、閱覽之間的運行路線，使讀者、工作人員、書刊的運輸路線便捷通暢，互不幹擾，形成壹個高效的整體，既為學校的未來發展預留了壹定的發展空間，又凸顯了國際化校園圖書館多功能、現代化、休閑化、個性化服務的人文理念。藏書300萬冊，不僅將成為NTU師生學習研究的文獻中心，還將為南京、江蘇乃至全國高校提供文獻信息服務，對提高全校教學科研信息保障能力，加快高等教育信息化進程和南京大學國際化進程具有重要意義。采訪部，132室:文獻出版信息收集整理；讀者需求分析與館藏利用信息:各種載體文件的選擇、收集和收集分發；確定收集方法和渠道，訂購各種文件；國內外文獻交流與贈送；拒絕圖書館文件。
編目部122室
1.分類編目組:負責中文、西班牙文、日文、俄文新書的查重、分類、主題標引、編目、校對和投稿。
2.藏書加工組:負責中外文新書的驗收、發行、調撥，管理藏書和院系賬目，辦理院系圖書交接，卡片、書標、磁條加工。
3.回溯建庫組:負責舊書的數字化回溯，充分揭示本館及院系的館藏資源，方便讀者OPAC檢索，為實現校際借還提供數據庫保障。
信息咨詢部(參考閱覽室)，102室
教育部部級科技查新工作站設在本部，直接為讀者提供高水平的文獻信息服務。網絡環境下，信息咨詢部利用現代化手段為讀者服務。信息咨詢部和查新站在信息檢索和信息分析方面有豐富的成果和實踐經驗。
多媒體閱覽室，401室
電子閱覽室提供兩項服務:
付費服務區:配備90臺電腦供師生使用。通過付費服務，讀者可以自行操作多媒體網站，此外，還可以為學會和協會提供多媒體資源增值服務。
教學服務區:配備70臺電腦，提供主頁提供的各種數據庫的學術信息檢索。
流通閱覽部
流通閱覽部是圖書館的主要公共服務部門，承擔著師生教學、科研、學習等獲取知識的重要任務，為江蘇省高校文獻資源的享用提供保障。由中外文圖書借閱室、期刊借閱室、外文閱覽室、電子閱覽室、樣書閱覽室、期刊收藏室和證書管理辦公室組成。
南京大學圖書館現當代地方文獻特藏
樣本閱覽室，421室
收集了30多萬種中文圖書，在室內用封閉的書架閱讀，讀者填寫索書單交給工作人員取書。老師也可以在倉庫裏查書。
外文閱覽室(外文教材中心、文科信息中心)，215室
由文科文獻信息中心、外文教材中心、外文借閱處合並而成，現擁有外文圖書4萬余冊。
中國借閱室302室
圖書借閱室(302室)是圖書館主要的圖書借閱場所，提供普通中外文圖書的借閱，並與浦口分館、學院、系、所聯網。這個房間裏有超過45萬本開架書，總圖書館的超過65，438+0.5萬本閉架書也是在這個房間的圖書館服務臺借閱的。
期刊閱覽室206室
期刊閱覽室(206室)提供中外文期刊、報紙和過期期刊的閱讀。近5年中國過刊開架展示，2002 -2006年室內過刊。同時展示10多種英文期刊和11多種大報。
古籍特藏部古籍閱覽室505室
古籍閱覽室藏書40余萬冊，有線裝古籍、大型影印古籍系列、新修訂的地方誌、文史資料、臺灣省鄉村文學、拓片、字畫、金大中1949以前的大論文、西方古籍及部分民國書籍。
古籍特藏部港臺圖書閱覽室406室
收藏港臺地區出版的社科類圖書5萬余冊，裝訂期刊1000余冊。其中，現刊288期，過刊300余期，訂閱港臺報紙9份。從20世紀50年代開始，港臺地區的哲學社會科學核心期刊也有比較完整的收藏。對研究生和教師開放。
古籍特藏部藝術閱覽室414室。
閱覽室藏書近兩萬冊，以南大L類圖書和《中國圖書館分類法》J類圖書為主，涵蓋繪畫、書法、音樂、建築、攝影、戲劇等，對師生開放。
數字建築部423室
成立於2003年，負責館藏在建數字資源建設，承擔數字項目的協調管理、資源選擇、組織制作等任務。主要通過珍稀特藏、古籍文獻、民國書刊、博士學位論文、南京大學圖書館的數字化建設，在保護圖書館珍貴文獻的同時，重點解決社科文獻相對匱乏的問題，最終在校園網上提供全文服務。
技術部316室
負責南京大學圖書館自動化系統的管理。確保整個系統(包括浦口分館和各部門分館)的正常運行和數據安全。負責管理和保障各項信息服務的正常開展。圖書館自動化系統相關硬件、機房設備、網絡設施的日常維護和物業管理。參與圖書館的網絡建設規劃。
CALIS/JALIS中心118室
負責CALIS和JALIS在本地區計劃任務的實施和組織。負責CALIS、JALIS等工作的協調。確保CALIS和JALIS服務(館際互借和文獻傳遞服務)的正常開展。組織相關業務培訓。
江蘇省關工委秘書處228室
在江蘇省教育廳和全國高校圖書情報工作委員會的領導下，負責江蘇計劃任務的實施和組織工作。負責與其他省市高校圖工委的協調與合作。通過專業委員會促進大學圖書館在所有業務領域的合作。
行政辦公室229室
辦公室是圖書館的行政辦公室，幫助館領導處理圖書館的日常事務，收集各種信息，協調內外工作，起著承上啟下的作用；同時，做好圖書館的後勤工作，保證圖書館各項工作的正常運轉，更好地為學校教學和科研服務。負責各種行政和業務文件的發送、歸檔和印章管理。
復印室113服務時間咨詢復印室。
物業值班室
早上7:00-晚上22: 00在壹樓大廳。
安全值班室，128室，晚上22:00-早上7: 00。
消防值班室101室24小時有人值班。壹、圖書館借閱處文明閱讀須知
1.鼓樓校區圖書館三樓的圖書借閱處，是讀者辦理圖書借閱手續，在室內看書的地方。請廣大讀者自覺遵守室內公共秩序，文明看書。請不要在閱覽室長時間討論。保持房間安靜。進入房間後，請將手機調至震動，盡量不要在閱覽室打電話或接手機。
2.請不要把書亂放，堆在書架上或塞在閱讀桌的抽屜裏。閱讀後請自覺把書放在手推車上。
3.請不要帶任何引起恐慌的書。請保管好您的貴重物品，以免丟失。
4.請不要用物品清空閱讀座位。如果座位空了超過30分鐘，其他讀者可以使用這個座位。圖書館不負責存放占用空間的物品。
為了讓每個人都有壹個幹凈健康的閱讀環境，請不要亂扔垃圾，隨地吐痰。請不要帶食物、飲料等。進了貸款辦公室。
6.請愛護圖書館圖書和設施，不要隨意塗寫或損壞。
7.註意安全，室內禁止吸煙、用火；嚴禁將易燃、易爆和腐蝕性化學物品帶入圖書館。
二、圖書借閱違規的處理
1.逾期處理:借閱圖書超過借閱期限，未及時辦理續借手續的，在還書時加收0.02元/天的逾期費。(讀者所借圖書的歸還日期，每年寒暑假可順延至新學期開學。
2.損失賠償:損失賠償:若書刊丟失，請盡量購買原書歸還，或按圖書館相關規定進行賠償。
3.損壞書刊:塗抹、汙損、撕毀圖書或丟失圖書背面條形碼的，按有關規定賠償。
4.偷書:當讀者離開圖書館時，把書藏在身上、書包裏或其他沒有借過的物品裏。壹旦被發現，將被視為偷書，按圖書館相關規定處理。
第三，借款規則
1，參考書、報刊、預約書、專書只看不借，其他書可以借。
2.最大借閱量:本科生8本(拔尖計劃和匡亞明大學12本)，研究生12本。期限為1個月。
3.所借圖書可續借1次，期限1個月。逾期未還或者未繳納逾期費的，不得續借。
4.讀者可以預約已經被別人借走的書，最多只能預約2本。
5.借閱圖書逾期的，應當繳納逾期費；如果借的書丟失或損壞，要賠償:可以買壹樣的書(理科書可以買新版，文科書必須買原版)或現金支付。
6.異地借閱圖書，可持校園卡和檢索到的圖書信息(索書號、書名)到服務臺辦理委托借閱手續，最多可借閱2本。在南京大學圖書館的歷史上，許多著名學者主持過圖書館事務。如國內著名圖書館學家、李、施廷鏞，國學大師，著名英國文學專家範存忠等。他們都為南京大學圖書館的發展做出了巨大貢獻。
1.劉國鈞，(1899-1980)
2.施廷勇，(1893-1983)
3.洪友峰，(1893-1963)
4.桂質柏，(1900-1979)
5.張江書，(1898-1989)，1951年-1959主持圖書館事務，擔任館長。
6.胡小石，(1888-1962)，1952-，是策展人。
7.李，(1897-1959)，1952-1959主持圖書館事務，任副館長。
8.範存忠，(1903-1987)，從1977開始負責圖書館事務，並擔任館長(副校長兼任)。
9.周伯勛，(1920-)，1986-1989主持圖書館事務，擔任館長。
10.包，(1932-)，1989-1996主持圖書館事務，任館長。
11.張勇濤，(1943-)，1996-1997主持圖書館事務，並擔任館長(兼任副校長)。
12.張亦斌，(1956-)，1997-2003主持圖書館事務，任館長(校長助理)。
13.錢乘旦(1949-)，2003年至2006年主持圖書館事務並擔任館長。
14.洪(1954-)，2006年起負責圖書館工作。