孔廟建築群時間久遠，集歷史、建築、雕刻、繪畫、書法等成就於壹體，是古老的博物館。它不僅是歷代統治者尊儒祭孔活動的歷史見證，也是綜合體現中國傳統思想文化的載體，更是勞動人民智慧的結晶。孔廟自始建以來，對中國社會的發展產生了重大而深遠的影響。
1.文化傳承與教化功能。從孔廟的發展史我們可以看出中華文化傳承的軌跡。孔廟之始，儒學的傳播尚處於萌芽狀態。漢初雖然已確定了“罷黜百家、獨尊儒術”的文化政策，但由於本土宗教道教文化與外來佛教文化對儒家文化的爭戰，以及其後三國、魏晉、南北朝綿延數百年社會分裂動蕩所引起的思想混亂，使儒家學術很難取得“獨尊”的地位。但在這壹時期，儒學吸收其他學派的成分，以適應社會的需要。至隋唐時期，天下壹統的局面形成，孔子及其創建的儒家學派所闡發的精神與學術思想經受了時間的考驗，儒家文化的價值得到了社會的廣泛認同，從而使大規模興建孔廟與長期傳播儒家文化成為可能。宋元明清各朝沿襲“獨尊儒術”的文化政策，不斷以尊崇的謚號封贈孔子，對孔廟建築的規格壹再提高，都表明了對儒家思想文化價值的肯定。
除曲阜孔廟外，自北朝開始在全國有關郡縣設立文廟學宮，文廟學宮從此有了“學校”的功能。這壹重要功能對隋唐以降的科舉制度起到了承前啟後的作用。尤其從唐代至清末，廟學不分，規制有前廟後學、左廟右學、左學右廟，還有中廟左右學、中廟周學等。廟學合壹的體制使歷代儒士文人在這裏接受了儒學的熏陶，尊經讀經即成為學校教育的重要內容，為各個時期培養了不同層次的學人。
自隋唐以後，儒學得到了長足的發展，並逐漸發展成了中華民族傳統文化的主幹，孔廟則是這壹文化的重要載體。孔廟祭祀操縱於國家，其目的在於厲行教化，即“廟以崇先聖，學以明人倫”〔8〕。祀孔表明，國家厲行教化的根本內涵是孔子之道，追求“君君、臣臣、父父、子子”理想化的禮制秩序。“仁義禮樂”是儒家之道，政治對儒道的汲取是為了建立有序社會，實現專制統治。“孔子以道設教，天下祀之，非祀其人，祀其教也，祀其道也”〔9〕。所以，祭祀孔子，也就是推崇他所創立的思想學說。
2.促進中華民族的融合與統壹。各地孔廟的建立，對於推動中華民族的融合與統壹功不可沒。在封建國家政令的要求下，無論是中原內地，還是邊陲地區，都曾設有孔廟。“自唐以來，州縣莫不有學，則凡學莫不有先聖之廟”〔10〕。遼代的上京（今內蒙古巴林左旗南）、中京（今內蒙古寧城西大明城）、西京（今山西省大同），都設有國子監，其旁建有孔子廟，按時祭祀先聖先師〔11〕。其各州、縣學也都有孔子廟。金朝沿襲前朝，除上京國子監有孔子廟而外，州縣也建有廟學。章宗泰和四年(1204)，“詔刺史，州郡無宣聖廟學者並增修之” 〔12〕。元朝在雲南建立行省後，於元世祖至元十五年（1278）在昆明建孔子廟。此後，大理、建水、通海、石屏等地也紛紛建立孔廟並使之制度化。到清末時，雲南全省除個別極邊遠的地方外，差不多所有州縣都有孔廟了。被譽為“海南第壹廟”的文昌孔廟始建於北宋慶歷年間，明洪武八年（1375）遷址於文城鎮。臺灣孔廟首建於今臺南市，建成於清康熙五年（1666）。臺灣地區興建孔廟較早者尚有彰化縣學（雍正年間）、鳳山（今高雄市）縣學（康熙年間）、及臺北府學（光緒年間）等。邊遠地區孔廟的建立，大大改善了當地教育落後的狀況。
儒家文化是中華民族***有的精神財富，而非僅被漢族所壟斷。這從孔廟建築者的族別上很容易看出來：南北朝時期鮮卑族的北魏孝文帝推行漢化政策，是史載最早在曲阜以外的城鎮修建“先聖廟”祭祀孔子的皇帝；女真族在進入中原、建立金朝後，代代皇帝尊孔祀孔，修建孔廟，如山西平遙文廟至今仍保留有金朝建築的格局；蒙古族建立的元朝不僅首在大都（今北京）修建孔子廟，奠定了北京孔廟的規格，還將孔子封為“大成至聖文宣王”，為歷代帝王封贈孔子的最高謚號；滿族則在建立清朝而未入主中原之前已奉行祭孔大典，並在東北地區建立了孔廟。
中華五十六個民族***奉孔子為“先聖先師”，在兩千多年的歷史長河中它緩和了民族矛盾，促進了各民族的不斷統壹。儒家文化規範了中華民族各階層的道德規範和行為準則，並成為壹種理念，是促進中華各民族加強團結攜手並進的精神紐帶。
3.藝術價值。孔廟是東方建築風格的具體體現，充分顯示了我國古代勞動人民的高度智慧和創造才能，在中國古代建築史上占有重要地位，曲阜孔廟是中國現存三大古建築群之壹。孔廟的建築遵從了我國傳統建築群中貫軸線，左右對稱的原則，布局嚴謹。孔廟作為祭祀性建築，其特殊性表現在它的標誌建築：其主建築大成殿大多采用擡梁鬥拱；泮池具有悠久的歷史，為孔廟所獨有；欞星門除用於個別高規格的祭祀建築以外，主要用於孔廟建築中；孔廟前的牌坊之多是其它類型的建築無法相比的。
在孔廟裏的雕刻是中國石雕藝術的上品，尤其是大成殿的石柱雕龍，更是石雕藝術的佳作。如山東巨野縣現存的明代文廟大成殿，殿四周有24根大型石柱支擎，前檐下8根石柱以及後檐端柱為高浮雕二龍戲珠，上綴浮雲，下著波濤，造型生動雕琢精工；其它石柱為淺浮雕纏枝花卉，構圖繁縟，技藝精湛〔13〕。
隨著時間的推移和朝代的更替，各地孔廟在建立、修繕、祭祀的過程中，留下了許多碑刻和匾額，具有較高的藝術價值。據統計，曲阜孔廟內***有碑碣1000多幢，包括祀孔碑、謁孔碑、修建孔廟碑、功德碑等，這些碑碣除了大量的用漢文刻成外，還有壹些少數民族文字，如滿文、蒙古文字等。無論從年代跨度上，數量上，對研究中國古代歷史文化，都是價值極高的寶庫。從碑刻和匾額的書法藝術看，各種字體兼備，風格不同，各具特色，也同樣是難得的珍品。地方文廟碑刻也不乏精品，如唐代著名書法家虞世南撰文並以正楷書寫的“孔子廟堂碑”，現存摹刻有二：壹在西安碑林，稱“陜本”或“西廟堂碑”；壹在山東成武，稱“成武本”或 “東廟堂碑”，現由縣文物室收藏，歷來為書家所喜愛。
在祭祀孔子的歷史過程中，還形成了獨具壹格的樂舞藝術。祭孔樂舞的內容以頌揚孔子生前的業績為主，是樂、歌、舞三位壹體的綜合藝術。其樂源於孔子所推崇的“韶”；舞因自“夏”；詩來自隋代牛弘、蔡徽的創作。樂曲八音齊全，古樸純正、典雅悠揚、金聲玉振。舞生以龠為舞具，舞姿剛勁舒展，具有雕塑之美。樂生演奏的樂器有古箏、笙、笛、簫、編鐘、編磬等。祭孔禮儀場面宏大，古樸嫻靜，而莊嚴肅穆的祭孔氣氛與金碧輝煌的大成殿，更形成了完美的藝術統壹。祭孔樂舞以其平和的曲調，適中的節奏，典雅的歌詞，謙恭的舞步，凸現出中國古代雅樂博大精深的思想意蘊，莊嚴恢宏的感人氣勢，以及中正和諧的藝術風格，集中展示了孔子及儒家倡導的“仁”、“和諧”、“禮讓”的人文價值。
另外，孔廟具有較高的史學價值。孔廟見證了中國兩千多年封建社會發展的歷程。在各地孔廟的發展史上，留下了豐富的遺存和資料，通過對有關孔廟歷史的研究，可以了解孔廟建築與祭孔活動的興衰，透視中國封建時代政治、經濟發展的狀況，對儒家乃至中國古代思想文化的演變進行深入的探討。