海馬篇 （BOSS-海馬瀨人，青眼白龍牌組 海馬公司） （001－002集）
決鬥者王國篇 （BOSS-有千年眼的貝卡索斯，卡通牌組 決鬥之島） （003—055集）
決鬥城市 上 （BOSS-有假千年錫杖的希利德，陷阱牌組 城市） （056—097集）
乃亞篇 （BOSS-海馬乃亞，方舟牌組；海馬剛三郎，大法師牌組 虛擬世界） （098—121集）
決鬥城市 下 （BOSS-有千年錫杖的黑暗馬利克，不死（太陽神）牌組 決鬥艇、決鬥塔） （122—142集）
多馬篇 （BOSS-達茲，奧利哈鋼牌組 美國） （143—184集）
KC篇 （BOSS-雷奧，童話牌組；傑克，戰女神牌組 海馬樂園美國分布） （185—198集）
埃及篇 （BOSS-有千年智慧輪的黑暗獏良，死靈牌組 古埃及） （199—219集）
決戰篇 （BOSS-有千年積木的黑暗武藤遊戲（法老阿圖姆），遊戲牌組 冥界之門）（220－224集）
001.戰栗的青眼白龍
002.幻想師 無顏的陷阱
003.丟失的埃及使者
004.決鬥開始！
005.究級完全體巨蛾
006.華麗的神鷹女郎
007.海神俐維但
008.被奪走的青眼白龍
009.起死回生！魔術師的大禮帽！
010.反擊！青眼白龍
011.友情之力！野蠻人1號與2號
012.黑之炎！真紅眼的黑龍！
013.變形壺的陷阱！炎之劍士的危機！
014.漆黑的決鬥！黑暗之城
015.切裂黑暗！光之護封劍！
016.激突！青眼白龍VS真紅眼黑龍！
017.恐怖！生死的呼聲
018.絕招！攻守互換
019.迷宮的黑暗決鬥
020.門之守護者
021.惡魔龍！黑魔龍
022.宿命的決鬥！遊戲VS海馬
023.最強！華麗！青眼究極龍！
024.栗子球增殖！驚愕的結果
025.淚之決鬥！友誼！
026.拯救目馬！海馬VS貝卡索斯！
027.海馬被打敗！無敵的卡通世界
028.決戰前夜！貝卡索斯的秘密
029.窮途末路！誘惑之影
030.傳說的最強的戰士！最終戰神降臨！
031.兇惡的機械卡組
032.超越時空！真紅眼的暗鐵龍！
033.友情的決勝戰！遊戲VS城之內（前篇）
034.友情的決勝戰！遊戲VS城之內（後篇）
035.最終決鬥！遊戲VS貝卡索斯
036.戰無不勝!? 無敵的卡通軍團
037.反擊開始！心靈混合
038.邪眼發動！祭品！
039.光與暗的融合！ 黑暗混沌降臨！
040.國王的決鬥
041.來自美國的少女！
042.必殺的影子怪
043.五大老的陷阱！決鬥怪獸搜索
044.傳說的勇者！ 遊戲
045.DM搜索之三 究極龍騎士
046.迷之轉校生 禦伽
047.對決！骰子大怪獸！
048.遊戲苦戰！ 奧格斯神的猛攻
049.奇跡的召喚！黑魔導！
050.從過去來的挑戰！戰栗的傑拉
051.被打碎的千年積木
052.王失去的記憶
053.炎之街舞戰
054.這城市成為了決鬥之城！
055.古魯斯強襲！被狙擊的真紅眼的黑龍！
056.激鬥！決鬥之城開幕！
057.逆轉！ 連鎖破壞！
058.天才鋁場 恐怖的心靈感應
059.用勇氣做賭註！迂回的輪盤蜘蛛
060.黑魔導使者 潘朵拉
061.魂的黑魔術
062.魔術師的徒弟！黑魔導少女
063.復仇的陷阱 暴走！帕拉薩德
064.鋼鐵的騎士 基亞·弗雷德
065.馬利克開始行動！神的組合
066.歐西裏斯的天空龍
067.超越神！究極的無限循環
068.看不見的敵人！深海奇襲||
069.傳說中的漁人
070.假面的咒縛 高層決鬥 潘朵拉
071.被封印的神之卡
072.團結！
073.奧貝利斯克的巨神兵
074.羈絆
075.無情的決鬥！ 遊戲VS城之內
076.到達！友情的真紅眼的黑龍
077.通往絕望的倒計時！
078.攻擊我吧！命運的最終回合！
079.鬼怪卡組VS超自然卡組
080.忍者使者！瑪古納姆
081.決鬥艇起飛！
082.天空的首戰！遊戲VS莫良（上）
083.呼喚死亡的牌組!
084.神的壹擊!打碎黑暗
085.隱藏之力 神之卡的謎
086.城之內 VS 陷阱卡組
087.繼承的魂之卡 精神震撼者反擊！
088.召喚！太陽神的翼神龍
089.神的憤怒！ 站起來城之內！
090.舞VS馬利克 黑暗決鬥！
091.奪取神之卡
092.古代神官文字之謎
093.海馬VS第8個決鬥者
094.改變未來的壹擊！
095.被說出的伊修達爾家的真相
096.馬利克VS莫良
097.壹回殺
098.未知的決鬥者！巨大機動要塞浮上！
099.卡組統領 深海的戰士
100.恐怖的再生組合
101.反擊的彩虹橋
102.冰上決鬥 被狙擊的杏子
103.閃耀！賢者的寶石
104.卡組統領 審判者的制裁
105.勝利的賭註
106.男人之花道 本田玉碎！
107.聖女貞德 三位壹體的攻擊
108.被離間的木馬 海馬VS精神震撼者
109.來自宇宙的攻擊！衛星加農炮
110.更深的謎團 乃亞的真面目
111.五大老的逆襲
112.被狙擊的城之內 與勝利聯系的技巧
113.打倒！五帝龍
114.乃亞VS瀨人 天地創造的決鬥（上）
115.乃亞VS瀨人 天地創造的決鬥（下）
116.拯救木馬！命運的第七回戰
117.卡組的繼承人！遊戲VS乃亞
118.基本分！10000 VS 100!!
119.海馬家的黑暗
120.大法師 奈克羅斯
121.奇跡的大逃亡！青眼白龍VS大法師的亡靈！
122.決戰之地 亞魯卡圖拉佐
123.大混戰！
124.各自的對戰者！
125.城之內VS馬利克！
126.城之內VS馬利克！
127.逆轉！閃電的戰士！
128.城之內之死！
129.天空的決鬥場！ 遊戲 VS 海馬
130.召喚神的三劍士
131.激突！奧西裏斯VS奧貝利斯克
132.真正的決鬥者的紐帶是否能拯救朋友!?
133.遊戲VS海馬 超越神的宿命之決鬥理由！
134.憎恨的射擊！黑暗帕拉丁
135.火焰的庸才王！城之內 VS 海馬
136.青眼白龍 VS 青眼白龍
137.真正的決鬥者的道路
138.決勝戰！ 遊戲 VS 馬利克
139.惡魔的聖域 發動！
140.不死之壁！再生神泥史萊姆
141.奧貝利斯克的憤怒 能量融合MAX
142.決鬥城市的終結！
143.亞魯卡圖拉佐起火
144.預兆
145.新的黑暗的跳動
146.奧利哈鋼的結界
147.無名的龍！提瑪歐斯之眼
148.來自貝卡斯的邀請函
149.卡通世界的惡夢
150.覺醒！克裏提歐斯之牙
151.無預期的敵人
152.黑暗中落下的舞
153.復蘇！第三只龍
154.海涅墨斯之爪的奇跡
155.目標！無名的法老王
156.遊戲VS拉非魯 鐵壁的守護者卡組
157.多瑪的真面目
158.遊戲心中的黑暗 提瑪歐斯消滅
159.被撕裂的靈魂
160.站起來遊戲！ 別輸城之內！
161.羽蛾＆龍崎 賭掉靈魂的決鬥
162.不能發動的提瑪歐斯！
163.對決！兩個人的遊戲！
164.奧利哈鋼的騎士
165.巴龍開始行動！謎之病毒裝甲
166.復仇的裝甲 天空中的決鬥
167.作戰！海馬！決死的空中大逃脫
168.天空的要塞 吉格拉特
169.激突！城之內VS巴龍
170.全裝甲重力場
171.互相響應的靈魂
172.激鬥的盡頭
173.痛苦的勝利
174.命運的決鬥！ 遊戲 VS 拉菲魯
175.不死身！守護者·死亡帝王
176.打擊心中的黑暗
177.決戰之地！達姿VS遊戲、海馬
178.亞特蘭蒂斯的悲劇
179.囚禁的鏡子空間
180.奧利哈鋼的三重結界
181.復蘇！傳說的三騎士
182.攻擊力無限大！蛇神彜
183.神與神的戰鬥
184.走在光芒中
185.KC最優秀杯開幕！
186.開始行動的陰謀
187.城之內VS武藤雙六
188.幻之古代龍
189.熱鬥！蕾貝加VS微微安
190.城之內VS傑克 華麗的決鬥
191.怪獸抹殺的女神
192.天才少女VS天才少年
193.童話世界裏的雷奧
194.海馬闖入！最優秀杯決勝戰！
195.戰女神 VS 青眼白龍
196.決鬥王決定戰！遊戲VS雷奧
197.修特羅姆·貝魯克的黃金城
198.KC最優秀杯終結
199.終極的黑暗遊戲
200.開始行動的莫良
201.被打開的記憶之門
202.盜賊王莫良參見！
203.瑪哈德的決心
204.死戰！瑪哈德VS莫良
205.藍色眼睛的其沙拉
206.千年道具誕生的秘密
207.倒退的時間
208.活著的法老
209.死靈之村
210.盜賊王莫良的死期
211.最新的舞臺
212.黑暗的神官
213.邪神復活的倒計時
214.白龍
215.大邪神佐克復活
216.傳說的守護神！黑暗大法師復活
217.召喚！三幻神
218.佐克VS青眼究極龍
219.在法老王的名義下!!
220.最後的試練
221.命運的最終決戰！
222.打倒三幻神！
223.堅強的心 溫柔的心
224.在光中完結的物語
第二部 遊戲王GX
01集：繼承遊戲的人
02集：火焰翼人
03集：星型人工智慧
04集：五重合體VWXYZ
05集：黑暗的惡魔牌組
06集：羽翼粟子球的奇跡
07集：翔的交通工具牌組
08集：最強！電子終極龍！
09集：必殺壹擊！回到飯桌！
10集：十代和翔宿舍決鬥（前篇）
11集：十代和翔宿舍決鬥（後篇）
12集：氧氣＋氫氣＝H2O龍
13集：野性解放！猴子決鬥！
14集：VS人造人索加
15集：青春的網球決鬥
16集：黑夜的哥布林王
17集：抽牌！抽牌！抽牌！
18集：VS遊戲牌組（前篇）
19集：VS遊戲牌組（後篇）
20集：戀愛的少女是強大的牌組
21集：融合封印！十代VS三澤（前篇）
22集：融合封印！十代VS三澤（後篇）
23集：沒勁！木瓜豆腐決鬥！
24集：復活！萬丈目閃電！
25集：VS萬丈目閃電（前篇）武裝龍的威脅
26集：VS萬丈目閃電（後篇）武裝龍LV7
27集：課外學習是黑暗決鬥（前篇）
28集：課外學習是黑暗決鬥（後篇）
29集：VS DarkNess（前篇）真紅眼黑龍的挑戰
30集：VS DarkNess（後篇）真紅眼黑龍的攻擊
31集：庫洛偌斯 VS 吸血美女卡繆拉
32集：愷撒 VS 卡繆拉！幻魔之門發動
33集：光輝！光閃羽翼人！
34集：溫泉旅情！青眼白龍！
35集：兄弟的團結！搞亂三角颶風！
36集：三澤地VS亞馬遜！娶親決鬥！
37集：肉彈決鬥！亞馬遜的死亡擂臺！
38集：水中決鬥！傳說中的城市亞特蘭堤斯！
39集：名偵探閃電 VS 黑蠍盜賊團
40集：H.E.R.O 閃光！
41集：暗之鬥牛場 發動！明日香 VS 泰坦
42集：學園祭決鬥！黑魔導女孩亂入
43集：給明日香的第二次戀愛機會！？
44集：第七人的影子
45集：VS Armnile！E.HERO完全封印
46集：地水炎風融合！賢者之石！
47集：明日香 VS 萬丈目！人工智能天使 －弁天－
48集：VS 影丸（前篇）兩個幻魔
49集：VS 影丸（後篇）三幻魔覺醒
50集：準人 VS 庫洛偌斯！艾雅斯巖的曰出！
51集：VS 愷撒（前篇）能量融合×電子終極龍
52集：VS 愷撒（後篇）最終融合
53集：命運的開始！新人生 愛德.菲尼克斯
54集：閃電 VS 精英君 金屬搗亂王出發
55集：寺院的劍山登場
56集：翔 VS 昆蟲少女！昆蟲女王
57集：愷撒 VS 艾德 職業聯盟賽的決鬥
58集：VS 艾德 （前篇） E.HERO 對 E.HERO!
59集：VS 艾德 （後篇）命運的 D.HERO!
60集：明日香 VS 吹雪 兄妹的偶像之路
61集：齋王登場！命運的占蔔卡組
62集：新E.HERO！NEOS！
63集：劍山 VS 咖哩魔人！辛辣決鬥！
64集：翔 VS 劍山！對大哥的火熱想念決鬥！
65集：地獄愷撒亮聚合機甲終結龍！
66集：遊城初夢決鬥！
67集：VS 艾德（前篇）新的力量！水之新生俠.水之海豚俠
68集：VS 艾德（後篇）炎之火焰新生俠.閃光金龜子！！
69集：克洛諾斯 VS 拿破侖！玩具士兵的進軍！
70集：明日香 VS 萬丈目白閃電！
71集：VS 遊戲霸者 巨大戰艦-旋輪開進！
72集：破壞“卡組破壞“吧
73集：劍山 VS 齊王！這是恐龍DNA！
74集：黃泉青蛙！生之青蛙！死亡青蛙！
75集：修學旅行搭檔決鬥
76集：究極合體！王者聯盟
77集：恐怖的四帝卡組！造物主EMA！
78集：最強組合！？十代&愛德！（前篇）
79集：最強組合！？十代&愛德！（後篇）
80集：絕望國度的美少女愛麗思！
81集：知識問答比賽！？VS 猜謎卡組！
82集：三池大地 VS 萬丈目！
83集：地獄愷撒亮VS師尊鮫島
84集：世界大會開幕！目標第壹！
85集：操縱神卡「拉之翼神龍」的男子！？
86集：決鬥的花道
87集：加油！搗亂3人組（上集）
88集：加油！搗亂3人組（下集）
89集：地獄凱撒VS暗吹雪
90集：學園的自尊心
91集：壹回殺的死神
92集：三方決鬥
93集：白夜的決鬥！十代VS明日香（前篇）
94集：白夜龍！十代VS明日香（後篇）
95集：仁至義盡的兄弟決鬥 亮VS翔
96集：相對性地形！十代VS天才博士
97集：登場！謎之世界冠軍！
98集：終於發動！究極的D之卡
99集： 十代VS鐳射衛星的恐怖
100集： 究極的秘密儀式『THE WORLD』
101集： 艾德 必殺的壹擊！『blood D』
102集： 光之波動 VS 尼奧斯
103集： 十代危機！場地魔法『光之結界』
104集： 勝利的去向？！十代 VS 齋王
105集： 新學期開始！波折的預感
106集： 十代和寶石獸卡組的約翰
107集： 新空間VS寶玉獸
108集： 教授·眼鏡蛇的刺客
109集 ：十代與炎之奧布賴恩
110集： 暴龍劍山與化石龍之吉姆
111集： 萬丈目閃電與雲卡組之阿蒙
112集： 閃電VS臺風之眼
113集： 十代VS背叛的元素英雄
114集： 絕體絕命！滿是傷痕的英雄
115集： 搜捕精靈的基斯
116集： 寶玉獸vs地獄的守門犬
117集： 決戰！十代vs科布拉教授
118集： 恐怖！毒蛇王維諾米農
119集： 三重結體融合！巖漿尼奧斯
120集： 異世界的戰鬥！寶玉獸VS神鷹女郎
121集： 沙漠的生存戰！約翰VS蟻地獄
122集： 決鬥學園危機！喪屍學生的恐怖！
123集： 麗救出作戰！E.HERO VS 墮天使護士
124集： 學園分裂！空腹決鬥
125集： 約翰·吉姆·奧布賴恩VS假面三騎士
126集： 十代VS萬丈目·龍騎士暗黑之劍
127集： 封印解除者·馬爾登
128集： 寶玉獸VS電子終結龍
129集： 三幻魔的威脅！十代VS馬爾登
130集： 虹龍覺醒
131集： 皇牌卡大集合！打開吧，次元之門！
132集： 賭上性命的決鬥
133集： 十代VS暗黑界的斥候斯卡
134集 ：十代VS暗黒界的騎士祖爾
135集： 十代VS暗黒界的狂王布隆
136集： 邪心經典發動！暗黑界之魔神雷恩
137集 ：翔的決心！「友情之證」
138集： 霸王降臨·死亡決鬥者們
139集 ：暗黑融合！地獄之翼！！
140集： 空前絕後·超融合發動
141集 ：恐怖的霸王！仿徨的奧布賴恩
142集 ：生存下來的勝利者就是正義！霸王VS奧布賴恩
143集： 火山惡魔VS最兇之邪心英雄
144集： 發動！究級封印解放儀式術
145集 ：究極封印神艾克佐迪奧斯召喚！
146集 ：被封印的融合
147集： 因緣的對決！電子流VS寶玉獸
148集 ：究極龍對決！電子終結VS黑虹
149集： 魔神對抗！幻魔VS艾克佐迪亞
150集：“休伯特”召喚！
151集： 尼奧斯VS高等寶玉獸
152集：超融合發動！彩虹新生俠
153集：被選中之卡對決！元素英雄VS休伯特
154集：蘇醒的霸王十代！
155集：彩虹新生俠VS休伯特究極態
156集：十代復活！？新的啟程
157集：潛在的威脅！「謎之來訪者」
158集：再見吧決鬥校園！十代選擇的道路
159集：Darkness的真相！十代VS吹雪
160集：融合之魂！新生俠VS五神龍
161集：Shall We Duel-我們去決鬥好嗎？配對決鬥的邀請
162集：十代VS明日香 隱藏了心意的覆蓋卡
163集：來自精神震撼者的挑戰書
164集：被繼承的電子暗黑龍
165集：目標！萬丈目，成為職業決鬥者之路！
166集 ：武裝龍VS龍騎·D·終焉
167集： 報恩的決鬥！克羅諾斯VS“吊車尾小子”
168集： 畢業決鬥開始！新生俠VS荷露斯之黑炎龍
169集： 決斷的代價！奧布賴恩的炎之暗
170集： 齋王再臨！「絕對命運決定力」發動！！
171集：命運之終焉！熔巖新生俠VS暗之支配者
172集： 決鬥學園的危機！阻擋在前的寶玉獸
173集：Darkness的侵占 被奪去的記憶
174集：發動！「凈界」恐怖的負影響
175集：大混戰！十代VS約翰VS藤原
176集： 羈絆守護者虹皇新生俠VS凈惰騎士
177集：恐怖的組合！「虛無與無限」
178集：最後之希望！遊城十代
179集： 再見了十代！淚之畢業禮
180集： 真の卒業デュエル！十代VS伝說のデュエリスト(真正的畢業決鬥！十代VS傳說的決鬥者)
第三部 遊戲王5DS
該故事以壹種叫D輪的交通工具來做卡片決鬥。
出到了43集.