1.重要礦物的代表性物理地質數據
據不完全統計，我國已發現172種礦產。國家自然地質檔案的收集工作應以國家的需要為導向，為國家的經濟建設提供公共服務。所收集的材料應能顯示該國成礦的地質特征和在部署重要工作中取得的主要成就。因此，國家物理地質資料館以國內重要礦種為首選，包括優勢礦種、戰略礦種和對國家經濟建設有重要意義的礦種。
22種重要金屬礦產:鐵、銅、鉛、鋅、鈷、鎳、鎢、鉬、鉍、銻、汞、錫、鉻、釩、鈦、錳、金、銀、稀土金屬、稀有金屬、鋁、鎂；20種重要非金屬礦產:菱鎂礦、螢石、耐火粘土、黃鐵礦、芒硝、重晶石、天然堿、石鹽、鉀鹽、硼、鍶、磷、金剛石、石墨、滑石、石膏、水泥石灰石、矽質原料、高嶺土、膨潤土；重要的能源礦產主要有石油、天然氣和煤礦。國務院關於加強地質工作的決定發布後，我國將進壹步加強石油、天然氣、煤炭、煤層氣、鈾、鐵、銅、鋁、鉛、鋅、錳、鎳、鎢、錫、鉀鹽、金等7種礦產的勘查力度，其中7種礦產尤為突出。
在重點礦種中，石油、天然氣、放射性礦產的實物地質資料由國土資源部直接委托數據生成單位保管。因此，國家物理地質檔案館主要收集金屬和非金屬的物理地質資料，重點是鐵、銅、鋁、鉛、鋅、錳、鎳、鎢、錫、金、稀土金屬、稀有金屬和鉀鹽的物理地質資料，以補充石油和煤炭的收集。
2.大型和超大型礦床的物理地質數據
考慮礦床規模，重點收集超大型礦床和大型礦床的物理地質資料，有選擇地收集具有特殊意義的中型礦床的物理地質資料。
目前，超大型礦床仍缺乏公認的統壹分類標準。這裏根據屠光池先生的《中國超大型礦床(上)》壹書，儲量超過大型礦床儲量標準5倍以上的礦床稱為超大型礦床。礦床規模按中國礦產儲量委員會1987公布的標準劃分。
礦床地質學家裴指出，超大型礦床是指那些礦產儲量特別大、具有特殊成礦特征的礦床，僅占礦床總數的7% ~ 10%，卻能解決全球70% ~ 90%的這種礦產資源，具有重要的經濟價值和戰略意義。
大型和超大型礦床數量雖少，但礦產儲量和經濟價值巨大。大型和超大型礦床往往是多種成礦控礦因素綜合作用的產物，具有獨特而復雜的成因和形成條件。實物地質資料符合典型性和代表性的壹般原則。這些物理地質資料的開發和利用有利於大型和超大型礦床的研究，對揭示礦床成礦規律和發展礦床成因理論具有重要作用。因此，有必要收集大型和超大型礦床的物理地質資料。
3.重要礦物主要成因類型的代表性物理地質資料。
考慮到礦床成因類型和采集的全面性，重要礦種中各成因類型的典型礦床是實物地質數據庫采集的對象。壹種礦物可能有不同成因類型的礦床，壹種或多種成因類型可能是主要的，其他成因類型是次要的。篩選時，應以該礦物的主要成因類型礦床為主要篩選對象，並選擇少量其他成因類型礦床，做到主次分明，相輔相成，全面篩選。
如銅礦床，可分為幾種成因類型。斑巖銅礦是中國最重要的銅礦，已探明儲量占總儲量的42%。其次是矽卡巖銅礦，探明儲量占總儲量的26%。因此，在銅礦床的篩選中，必須以這兩種成因類型為主，兼顧其他成因類型。篩選出每個成因類型中最典型、最有代表性的礦床物理地質資料。
4.重要礦種主要成礦時代形成的礦床物理地質資料。
從成礦時代來看，中國礦產總體跨度很大。從某些單壹礦物種類來看，雖然時間分布跨度也很大，但不同時期形成的礦床數量很不均勻。例如，根據郭對我國544個主要內生金屬礦床成礦年齡的統計分析，55%的內生金屬礦床形成於中生代；大多數有色金屬礦床的成礦時代為中生代；鐵礦主要分布在太古代-元古代的古老地層中。
因此，在篩選和收集礦床物理地質資料時，應充分考慮礦種與主成礦時代的關系，重點收集該礦種主成礦時代形成的礦床物理地質資料，補充收集次成礦時代的物理地質資料。
5.不同成礦帶代表性礦床的物理地質資料。
中國幅員遼闊，位於歐亞板塊、太平洋板塊和印度板塊的交匯處。各時代地層發育良好，構造復雜多變，巖漿活動強烈且多期次，礦產資源豐富。但不同構造域的礦床類型、成礦元素組合、礦床空間分布特征、不同成礦時代的強弱是不同的，它們之間存在著某種規律性的內在聯系。在篩選礦產資源物理地質資料時，應充分結合成礦帶的劃分，篩選特定成礦帶中最具代表性的礦床物理地質資料。如長江中下遊銅鐵金成礦帶，主要礦物為銅、鐵、金、硫，主要成因類型為接觸交代型和陸相火山-侵入巖型，主要成礦時代為燕山期。通過這樣壹系列的鎖定，在長江中下遊成礦帶中選出大冶鐵礦、銅綠山銅礦、冬瓜山銅礦和梅山鐵礦。
6.其他具有重要特殊意義的礦床物理地質資料。
主要包括具有重要特殊成因意義、工業意義、經濟意義和礦物學意義的礦床，在礦業發展史上具有重要意義的礦床，新類型礦床，新類型礦種或某些非傳統礦產資源。這類實物地質資料也是國家實物地質檔案館的收集對象。
如海南石碌鐵礦，是我國重要的富鐵產區；山西銅礦峪銅礦床是中國最古老的斑巖銅礦床。四川什邡磷礦形成於中泥盆世，不僅含有碳氟磷灰石，而且具有工業價值，其成礦時代和礦石組成世界罕見。江蘇東海白雲母礦床是國內外唯壹具有工業意義的鎂矽白雲母；江西景德鎮幸子高嶺土礦是景德鎮陶瓷的主要原料。安徽銅官山銅礦和甘肅白銀廠銅礦開采歷史悠久，在新中國成立初期的國家建設中發揮了巨大作用，在我國礦業發展史上占有重要地位。
新的礦床類型和新的礦物類型是地質學家獲得的新認識。這種新認識往往對豐富成礦理論、開發利用礦產資源和礦物學研究起到不可估量的作用。例如，河北省東坪金礦是我國第壹個產於堿性雜巖體中的新型礦床。它的發現和開發將使與堿性巖有關的金礦成為我國重要的金礦資源工業類型之壹，開辟了我國金礦找礦和理論研究的新領域。四川省石棉縣大水溝碲鉍金礦是世界上第壹個獨立的碲礦床。過去人們認為碲不能單獨形成工業礦床。大水溝獨立碲礦床的發現是對以往認識的突破。
新的礦物類型，如天然氣水合物；非傳統礦產資源，如海洋沈積物中的金屬軟泥、多金屬結核和硫化物礦床；又如西藏紮布耶鹽區含銫矽質巖、鈣華，西藏羊八井熱田輝銻礦化。這類實物還應包括極地礦產資源調查研究獲得的實物。
7.海外礦床的物理地質數據
隨著經濟的發展，對礦產資源的需求日益強烈，充分利用國內外礦產資源成為必然。通過風險勘探和國際交流收集海外礦產的物理地質資料是篩選和收集物理地質資料的壹個重要方面。國家物理地質檔案館收集的重點是:壹是與我國成礦環境相同的國家或地區的礦床與國內部分礦床有可比關系；二是國外特有而國內未開發的礦床成因類型；三是國外礦產資源勘查項目取得重大成果的物理地質資料。