董其昌才溢文敏，通禪理、精鑒藏、工詩文、擅書畫及理論。他是海內文宗，執藝壇牛耳數十年，是晚明最傑出、影響最大的書畫家。董其昌的繪畫長於山水，註重師法傳統技法，追求平淡天真的格調，講究筆致墨韻，墨色層次分明，拙中帶秀，清雋雅逸。《畫史繪要》評價道：“董其昌山水樹石，煙雲流潤，神氣俱足，而出於儒雅之筆，風流蘊藉，為本朝第壹。”董的繪畫對明末清初的畫壇影響很大，並波及到近代畫壇。壹直以來，董其昌的作品都是海內外大收藏家尋覓的目標。
董其昌精收藏，曾珍藏董源4幅山水《瀟湘圖》、《溪山行旅圖》、《龍宿郊民圖》、《夏山圖》，並以“四源堂”名齋，還有精選李思訓《蜀江圖》、《秋江待渡圖》，董源《征商圖》、《雲山圖》、《秋山行旅圖》，巨然《山水圖》，範寬《雪山圖》、《輞川山居圖》，李成《著色山圖》，郭忠恕《輞川山居圖》，江貫道《江居圖》，趙大年《夏山圖》，趙子昂《洞庭二圖》、《高山流水圖》，王蒙《秋山圖》，《宋人冊頁》等18幅。從中可以看出，董其昌的收藏足以令其傲視當代。
董其昌的書法成就也很高，董的書法以行草書造詣最高，他對自己的楷書，特別是小楷也相當自負。董其昌雖處於趙孟頫、文征明書法盛行的時代，但他的書法並沒有壹味受這兩位書法大師的左右。他的書法綜合了晉、唐、宋、元各家的書風，自成壹體，其書風飄逸空靈，風華自足。筆畫園勁秀逸，平淡古樸。用筆精到，始終保持正鋒，少有偃筆、拙滯之筆；在章法上，字與字、行與行之間，分行布局，疏朗勻稱，力追古法。用墨也非常講究，枯濕濃淡，盡得其妙。書法至董其昌，可以說是集古法之大成，“ 六體”和“八法”在他手下無所不精，在當時已“名聞外國，尺素短劄，流布人間，爭購寶之。”（《明史·文苑傳》）。壹直到清代中期，康熙、乾隆都以董的書為宗法，倍加推崇、偏愛，甚而親臨手摹董書，常列於座右，晨夕觀賞。康熙曾為他的墨跡題過壹長段跋語加以贊美：“華亭董其昌書法，天姿迥異。其高秀圓潤之致，流行於褚墨間，非諸家所能及也。每於若不經意處，豐神獨絕，如清風飄拂，微雲卷舒，頗得天然之趣。 嘗觀其結構字體，皆源於晉人。蓋其生平多臨《閣帖》，於《蘭亭》、《聖教 》，能得其運腕之法，而轉筆處古勁藏鋒，似拙實巧。……顏真卿、蘇軾、米芾以雄奇峭拔擅能，而要底皆出於晉人。趙孟頫尤規模二王。其昌淵源合壹，故摹諸子輒得其意，而秀潤之氣，獨時見本色。草書亦縱橫排宕有致，朕甚心賞。其用墨之妙，濃淡相間，更為絕。臨摹最多， 每謂天姿功力俱優，良不易也。”據說，康熙還親自臨寫董書，致使董書得以風靡壹時，出現了滿朝皆學董書的熱潮。壹時追逐功名的士子幾乎都以董書為求仕捷徑。 在康熙、雍正之際，他的書法影響之深，是其他書法家無法比擬的。
董其昌的書法，歷來評說褒貶不壹。褒者傾其溢美之詞，清代著名學者、書法家王文治《論書絕句》稱董其昌的書法為“書家神品”。謝肇稱其“合作之筆，往往前無古人”。周之士說他“六體八法，靡所不精，出乎蘇，入乎米 ，而豐采姿神，飄飄欲仙”。但對董其昌的批評者也很多，包世臣、康有為最為激烈。包世臣雲：“行筆不免空怯”。康有為《廣藝舟雙楫》諷刺道：“香光（董其昌）雖負盛名，然如休糧道士，神氣寒儉。若遇大將整軍厲武，壁壘摩天，旌旗變色者，必裹足不敢下山矣！”
董其昌走上書法藝術的道路，出於壹個非常偶然的機會。起因是在考試時書法不好,遂發憤用功自成名家。這在他的《畫禪室隨筆》有所記述，其中還自述學書經過：他在十七歲時參加會考，松江知府衷貞吉在批閱考卷時，本可因董其昌的文才而將他名列第壹 ，但嫌其考卷上字寫得太差，遂將第壹改為第二，同時將字寫得較好些的董其昌堂侄董源正拔為第壹。這件事極大地刺激了董其昌，自此鉆研書法。董其昌回憶說：“郡守江西衷洪溪以余書拙置第二，自是始發憤臨池矣。初師顏平原 （真卿）《多寶塔》，又改學虞永興（世南），以為唐書不如魏晉，遂仿《黃庭經》及鐘元常（繇）《宣示表》、《力命表》、《還示帖》、《丙舍帖》。 凡三年，自謂逼古，不復以文征仲（征明）、祝希哲（允明）置之眼角。”這段話中可以看出董其昌幾乎學習研究了以前絕大部分名家，從鐘王到顏、柳，從懷素到楊凝式、米芾，直至元代的趙孟頫。
董其昌沒有留下壹部書論專著，但他在實踐和研究中得出的心得和主張，散見於其大量的題跋中， 董其昌有句名言：“晉人書取韻，唐人書取法，宋人書取意。”這是歷史上書法理論家第壹次用韻、法、意三個概念劃定晉、唐、宋 三代書法的審美取向。這些看法對人們理解和學習古典書法，起了很好的闡釋和引導作用。董其昌壹生勤於書畫，又享高壽，所以傳世作品很多，代表作有《白居易琵琶行》，《三世誥命》、《草書詩冊》、《煙江疊嶂圖跋》、《倪寬贊》、《前後赤壁賦冊》等