“重慶中醫藥博物館”掛牌後，根據市政府2009-154專題會議紀要，“重慶中醫藥博物館建設與中醫藥研究院轉型”項目已全面啟動。
植物標本館約有33萬種中國藥用植物和動物標本，其中藥用植物30萬種，藥材65438+50萬種，動物標本7000多種。各類標本主要采集於中國西南、青藏高原和西北地區，這些地區中藥資源豐富，生物多樣性和種類最具特色，涉及6500余種(占全國藥用植物總數的壹半以上[12080種])。采集時間跨越70余年(1930~2006年)，記錄和反映了我國西南至西部地區中藥資源的珍貴資料。許多物種為中國乃至世界稀有物種，共采集模式標本110余種。特別是我院在承擔“六五”至“十五”國家科技攻關項目期間收集和保存的特殊研究標本，如川貝母、冬蟲夏草、大黃、石斛、麻黃等。，包括65，438+0，000余份中醫藥、民族醫藥國家標準標本(十五國家重大基礎設施項目)，具有保存標本品種齊全、資源相關信息記錄詳細的特點，具有較高的科研性。
這些標本對了解和掌握我國西南、青藏高原和西北地區的中草藥資源狀況，進行中草藥資源的保護、開發和可持續利用，以及研究我國植物分類學和植物區系具有重要的科學價值。在市科委的支持下，建立了館藏標本電子檢索系統。