而有些類似信息矩陣的技術，由於編碼方式的開放性和印刷技術的普及，並不具備真正的防偽特征。只有具有排他性特征的特殊信息矩陣，不能被社會上其他企業或組織破解和反編譯，才能有效保證標簽的防偽功能。由於信息矩陣具有隱形、加密的編碼體系，也可以像壹維條碼、二維碼、數字密碼壹樣，很好地應用於物流管控領域。而且，作為壹種隱形(數字加密信息肉眼不可見)、全息(局部帶有全局信息內容)和印刷閾值技術，信息矩陣和閱讀器的結合不僅可以提供與條形碼相同的物流管控功能，還可以以隱藏的方式實現物流功能。
在物流管理和控制的應用中，讀取設備壹般是在線的，因此可以與計算機或通訊設備實時通信，為企業的檢驗部門防止貨物逃逸提供了非常方便的手段，進而提高了追溯和取證的效率。信息矩陣還可以應用到壹些特殊的印刷品上，在不影響外觀的情況下，為讀者提供遠多於圖形信息的動態信息內容，並可以實現與印刷品的互動。
傳統的應用方式是書籍，多用於企業宣傳、收藏品、有大量音頻信息的宣傳冊等。隨著在線和網絡化閱讀器的不斷出現，信息矩陣被廣泛應用於通過網絡與印刷材料進行交互和實時更新數據信息。
目前常見的應用有股票信息查詢、餐飲業自動點菜、智能家居控制等。信息矩陣作為壹種光學識別技術，也應用於物聯網領域，作為壹種接觸式或短距離非接觸式感應標簽，應用於物聯網產業的壹些特定領域。