危害地瓜貯藏的重要因素包含濕度和溫度。地瓜怕凍，溫度低（<10℃）會讓地瓜產生受凍，輕度的受凍危害口味，使紅薯蒸不太熟或是煮不碎，口味比較差。溫度太高，地瓜非常容易出芽。壹般認為地瓜適宜的貯藏溫度15℃上下。貯藏時環境濕度過會造成細菌滋生，造成地瓜幹腐病或是軟腐病等，因此貯藏空間要註意通風，不可以密閉式過嚴。
此外，地瓜獲得時如果有傷害或蟲蛀等也會影響到貯藏。種植戶得話，能將地瓜存放在專門的地下室、屋窖和棚窖中，這樣的情況下，紅薯可以存儲到第二年的新地瓜大豐收。華北地區溫度非常低，可以采取井窖的形式，挖井的深度在5米長，下孔孔徑會比外沿孔徑窄壹些，上井筒直徑大約1m上下，下井筒直徑大約1.5m前後。井中必須墊壹些河沙。別的地方可以采用棚窖和屋窖的形式。
棚窖的話需要挖長3-4米，深2米，寬2米地下室，紅薯是由底端慢慢往上沈積，在其中更為省事的便是屋窖了。地下室存儲是以前鄉村儲存紅薯較為常見方式，實際操作十分簡單。在自家附近找壹個適宜的地勢高、土層硬、水位線低的地塊，依照寬度深3米： 2米:2米占比挖好地下室，並把地瓜堆積在窖內（切記不能讓地瓜直接和窖壁觸碰），之後在覆蓋上壹層塑料薄膜。
再用壹些樹技/稭桿和土覆蓋在上邊，基本就大功告成了，留通風口上膠就行了。地下室大小也可以根據要儲存紅薯數量的是多少按比例分配調節，地瓜多就挖大點，地瓜小就挖小些。如果覺得棚窖也很不方便，也可以將紅薯放到屋子裏保存，屋子周圍可建壹圈火道，可以將屋子裏的水分烘幹，並建壹個通風的通道，方便屋子通風透氣。儲存紅薯的屋子不用太大。