這個故事的主人公。真實身份是偵探工藤新壹，壹名高中生。他變小是因為被黑組織成員用APTX4869下毒。後來為了調查黑組織，他改名為“江戶川柯南”，留在毛利偵探所。目前就讀於迪丹小學壹年級B班，是少年偵緝隊的壹員。
工藤新壹
迪丹高中B班學生，高中偵探，被稱為“平成時代的福爾摩斯”、“日本警察的救星”，很多案子都是在他的積極下破的。後來他被黑組織毒害，身體變小了。
毛利蘭
這個故事的女主角。迪丹高中二年級B班，毛利小五郎的女兒，學校空手道俱樂部的領導。毛利偵探社的女主人，柯南現在的監護人，新青梅竹馬的女朋友。
毛利小五郎
小蘭的父親。我以前是警察，後來成了私家偵探。很多時候他是壹個需要柯南的力量才能破案的糊塗偵探，但壹旦遇到和他有關的人的案子，他就會表現出驚人的推理能力。擅長柔道。
阿笠博士
信義的鄰居，發明家。和工藤優作是好朋友。有很多發明，但大多數都失敗了。心怡成為柯南後，發明了很多有用的道具來幫助柯南。
海原愛
迪丹小學壹年級B班的學生。真實身份是宮野誌保(組織代號:雪莉)，黑人組織成員。後來因為姐姐明美被殺，拒絕與組織合作而被囚禁。為此她拿了APTX4869，把身材變小了。後來，她住在阿笠博士的房子裏，後來成為少年偵探隊的壹員。
少年偵探小組
吉田步美
迪丹小學壹年級B班的學生。壹個天真善良的女孩喜歡柯南。
圓谷光彥
迪丹小學壹年級B班的學生。我很熱衷於學科學，思維模式比較理性，喜歡美和悲。
小島元太
狄丹小學壹年級B班，少年偵探組組長(自稱)。非常貪婪。我最喜歡的食物是鱔魚飯。他很魯莽，但他有正義感。比如步美。
小林澄子
迪丹小學壹年級B班班主任，少年偵探團顧問(自稱)。我喜歡讀埃德加瓦·拉波爾的小說。我小時候見過白鳥警官壹次，現在我和白鳥警官有聯系。