在選擇南紅瑪瑙的時候，需要先看顏色，因為顏色直接決定了南紅的價值和品相。南紅瑪瑙分幾種顏色，如錦紅、柿紅、玫紅、櫻桃紅、紅白料、冰籽等。像緞子這樣的錦緞是最珍貴的，這種顏色往往很難找，所以價格自然很貴。然後是柿子紅，在市場上更受認可和歡迎。南紅的這種顏色雖然沒有金紅好看，但也不失收藏價值。隨著南紅瑪瑙的開發，將來柿子紅的收藏價值會和翡翠中的王綠、和田玉中的羊脂玉壹樣。
其次，以上兩種顏色很有收藏價值，但不代表其他顏色沒有價值。只要南紅原石漂亮，色澤均勻，就有收藏價值。質量好的南紅瑪瑙遇上名家的雕刻工藝，可以說是錦上添花，價格水漲船高。
在選擇南紅瑪瑙的時候，大方向要多註意顏色和雕工，小方向要多註意細節。比如挑選時，註意挑選無裂紋、雜質少、質地均勻的南紅。這個可以自己收藏，以後賣個好價錢。