第壹，形式差異
增值稅發票電子版以電子數據形式存在，通過特定的電子發票系統生成、傳輸和存儲。它具有數字簽名和防偽技術，確保發票的真實性和不可篡改性。紙質版發票是傳統的紙質形式，通過打印或手寫完成，需要加蓋發票專用章以證明其真實性。
第二，存儲和訪問
電子發票可以方便地在電子系統中存儲和查閱，並且不受物理空間的限制，易於備份和恢復。紙質版發票需要占用物理空間進行存儲，查閱時可能需要閱讀大量紙質文件，相對繁瑣。
第三，使用方便
在使用方面，電子發票可以隨時隨地通過電子設備進行查詢和傳輸，大大提高了交易效率和便利性。紙質版發票需要郵寄或人工送達，時間和成本都比較高。
第四，管理要求
在管理上，電子發票需要建立完善的電子發票管理系統，保證電子數據的完整性和安全性。紙質發票需要按照相關規定歸檔保存，防止發票丟失或損壞。
總而言之:
增值稅發票電子版在形式上不同於紙質版，但在功能上都是作為稅收憑證的重要憑證。電子版發票具有存儲方便、查閱快捷、使用方便的優點，而紙質版發票具有實物存在、直觀易懂的特點。在實際應用中，企業可以根據自身需求和實際情況選擇使用電子發票或紙質發票。
法律依據:
中華人民共和國電子商務法
第14條規定:
電子商務經營者銷售商品或者提供服務，應當依法出具紙質發票或者電子發票等購貨憑證或者服務單據。電子發票與紙質發票具有同等法律效力。
中華人民共和國發票管理辦法
第23條規定:
安裝稅控裝置的單位和個人應當按照規定使用稅控裝置開具發票，並按期向主管稅務機關報送發票數據。
使用非稅控電子設備開具發票的，應當將非稅控電子設備的軟件程序描述數據報主管稅務機關備案，並按照規定保存和報送發票數據。
國家積極推廣使用網上發票管理系統開具發票。