北京人頭蓋骨是我國彌足珍貴的考古文物，上個世紀二十年代，我國開始對北京人遺址進行大規模的開掘，在這次挖掘過程中，出土了多塊完整的北京人頭蓋骨。然而這批珍貴的古物在出土後便先後經歷了多次戰亂，最終導致了它們消失在了人們的視野中。待戰亂平息後，我國開始聯合美國、日本、韓國等國家對這批消失的北京人頭蓋骨進行搜尋，但最終都無功而返。目前，這個北京人頭蓋骨到底在哪兒還沒有壹個確切的訊息，但經過多方探尋，最後找到了五條線索。壹是這個化石被帶到了美國，在1972年美國壹位商人對這批丟失的化石產生了興趣，當時他出資5000萬美元來尋找線索，但得到的線索最終都被否決了，最終他是否找到了仍是壹個未知數。此外，還有壹條線索是說那個化石在日本的壹艘沈船上，這艘沈船名為?阿波丸?號，此後，我國曾組建壹直搜尋隊對該船進行過搜尋，但也沒有發現蹤跡。
第三條線索是說這個北京人頭蓋骨被帶到了日本，被壹個名為遠藤龍次的古人類學專家收藏了。這個訊息是從他的女婿中田光男的回憶錄中得知的，據說遠藤龍次曾帶中田光男見過這些神秘的完整骨化石。但後來，我國的專家經過驗證，否認了他的說法，這些骨化石並非是北京人頭蓋骨。
第四條線索是化石並未被帶出國，而是留在了二戰時期天津的美軍兵營。這個訊息是在《北京人》壹書中得知的，據書中所記載，化石被埋在了壹個壹處木板層下，但後來據考證，此處並沒有木板層，所以這個說法也是不準確的。最後壹條線索是說北京人頭蓋骨仍在美領館，在是二戰時期壹名美國士兵透露的，他說在珍珠港遇襲之前，曾有人將裝有失竊化石的箱子埋在了哨崗附近，這個說法還處於考證之中。