天然水晶的基礎價格由水晶的品種決定，水晶大致有這麽幾個品種：白水晶（透明無色）、茶晶、紫水晶、黃水晶、綠幽靈（其他色幽靈）、兔毛水晶、發晶（包括鈦晶）等。其他壹些半寶石也被稱為水晶，像石榴是、月光石、黑耀石等等，但都不是真正意義上的水晶，粉晶（薔薇石英）與水晶成分相同但結構稀疏，也被稱為水晶。
就品種而言粉晶、白水晶和茶晶是最便宜的品種，紫水晶稍貴，黃水晶比紫晶貴壹點（假的很多）。幽靈、兔毛、發晶是內含包裹體的水晶，是水晶中較貴的品種，其中黑發晶、銅發晶（“銅”發順）和鈦晶（鬃晶）是最貴的品種，價格可高達上萬（手串價格）。
在相同品種中的價格差異主要由成色決定同時與珠子的大小有關（手鐲普遍比手串貴很多）。成色好就是晶體純凈，無綿無裂，有包裹體的還要看包裹體的形狀。
如果不能正確辨識天然水晶，就不要買太純凈的，這種造假容易而且價位都成百上千。有包裹體的可以比較放心購買，造假很少，只是聽說過，還沒見過實物。成色不好的壹般都是真的。
大概價格（壹般尺寸、成色的手串市場價）：
白水晶、茶晶10元——200元
紫水晶10——800
黃水晶50——1500
綠幽靈100——3000
兔毛50——1000
黑發晶100——10000
銅發順200——10000
鈦晶100——20000
有些極品更貴