廣東海洋大學水生生物博物館於7月1991日正式對外開放。湛江水產學院原黨委書記盧金倫為博物館開館題詞:“努力辦好博物館，是對水產事業發展的壹大貢獻”。1991 9月13日，湛江人民廣播電臺播出了這座博物館正式開館的消息。
1997年7月，廣東海洋大學水生生物博物館為中國海洋科學院海洋研究所原副所長、南海海洋研究所所長、海洋湖沼學家、我國貝類科學奠基人張西教授建立了“張西教授紀念館”。
1998年6月，廣東海洋大學水生生物博物館為中國院士、中國科學院海洋研究所名譽所長、廣東海洋大學學院名譽教授、中國代數奠基人曾成奎院士建立了“曾成奎院士表演館”(2005年9月改為紀念館)。
1999 65438+2月，廣東海洋大學水生生物博物館為原上海水產學院院長、水產教育家、我國魚類分類學主要奠基人朱教授建立了“朱教授紀念館”。
2006 54 38+0 6-8月，經上級領導重視，決定新建博物館大樓。
2004年6月，壹座占地5000多平方米的嶄新建築終於落成，廣東海洋大學水生生物博物館從霞山校區遷至湖光巖主校區。
2005年6月，165438+10月，廣東海洋大學水生生物博物館水族館竣工，正式對外開放。