奉先殿重建於順治十四年，歷經多次修繕，成為明清皇室祭祖的專用場所。它有前廳和後廳，陳設也不壹樣。前殿主要陳列奏折，後殿是牌位。供奉明清祖先的牌位有33塊，僅清代牌位就占11。
11畫像和牌位分別是:太祖(努爾哈赤)、太宗皇太極、賽祖(順治皇帝福臨)、聖祖(葉璇、康熙皇帝)、世宗(胤禛、雍正皇帝)、高宗(李鴻、乾隆皇帝)、仁宗(嘉慶皇帝)。
當時因為八國聯軍的肆意侵略，乾隆皇帝的牌位遭遇了滅頂之災，最後落在了德國的地窖裏，在拍賣會上被中國人以400萬元贖回。顯然還是有壹些波折和成本的。直到溥儀被趕出紫禁城，所有財產被沒收，歸中華民國政府所有。當時成立了“潔凈室改造委員會”。
後宮常年失修，導致屋頂漏雨。為了保護皇帝的牌位和畫像，故宮的工作人員把它們搬走了。溥儀借此機會回到了祖先牌位上。但故宮認為這些是國家文物，不能交給私人保管。