我們人眼的虹膜由五層組織組成。它們是內皮細胞層、前界膜、基質層、後界膜和後上皮層。在這五層組織中，基質層、前界膜和後上皮層有許多色素細胞，這些細胞所含色素的多少決定了虹膜的顏色。
色素細胞中含有的色素越多，虹膜越黑，眼球越黑。色素越少，虹膜顏色越淺，眼球顏色越淺。
色素細胞中的色素含量與膚色壹致，與人種遺傳有關。東方人是有色人種，虹膜裏有很多色素，所以眼睛看起來是黑色的；西方人是白種人，虹膜色素少，間質血管少，所以眼睛看起來是淺藍色的。