收藏區由兩部分組成:前區和收藏區。倉庫前的建築包括卸貨平臺、開箱室、登錄室、清潔室、消毒室、編目和目錄室等。根據博物館的規模，大型博物館配有各種房間，而小型博物館往往會結合類似性質的工作室。按照博物館保管的慣例，藏品是分類存放的，所以青銅器庫、陶瓷器庫、書畫庫、刺繡庫是有區別的。此外，根據藏品的珍貴程度，往往會分別設置典藏館和壹般典藏館。自然科學博物館的庫房壹般按學科分類保存，如鳥類、哺乳動物、魚類、兩棲動物、爬行動物、無脊椎動物等標本庫。根據不同的標本制作方法，分別建立濕標本庫和幹標本庫，分別放置浸泡標本、蠟葉標本、生態標本和假剝標本。倉庫的建築設計通常根據藏品的性質、儲存要求和珍貴程度，確定防震、防火、防盜的等級，以及相應的防潮、避光等措施。
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