《奈克賽斯·奧特曼》背景：近來世界各地不斷有“異生獸”作亂的報告。為了暗中解決這個問題，成立了世界性的防衛組織TLT的下屬特種部隊夜襲隊NR（Night Raider）。他們的任務就是秘密消滅異生獸。但是，巨型異生獸突然出現在擁有驕人戰績的夜襲隊面前，他們陷入了苦戰。這時，光之巨人奈克賽斯·奧特曼登場了！本作中出現了同壹個奧特曼的五個人間體（包括奈克賽斯·奧特曼的前身奈克斯特·奧特曼的人間體真木舜壹，出場於劇場版《ULTRAMAN》），他們被稱作適能者1。此外，《奈克賽斯·奧特曼》及其前傳《ULTRAMAN》屬於奧特曼系列中的獨立的世界觀的故事。奈克賽斯·奧特曼在《艾克斯奧特曼》中也有登場，並且出現了新的適能者。