細菌房(又稱細菌環)是培養硝化細菌的溫床，生活在好氧水體或沙層中，在氮循環水質凈化過程中起著重要作用。菌屋都是圓柱體，中間有洞，邊上有很多小孔。這種結構可以使菌舍非常透氣、透水，有利於硝化菌的培養和生產。但它的缺點是占地面積大，空間利用率不是很高。