珍貴古籍
重慶圖書館收藏有宋代以來的古籍線裝書532342冊，其中收入《全國善本書總目》的有3707種，55632冊，內有孤本和稀見本424種，包括《欽定四庫全書簡明目錄》、《山谷老人刀筆》、《清江貝先生文集》等珍貴古籍，古籍線裝書的數量和質量均列中國西南地區首位，在中國位居前列。
聯合國文獻
從1999年起，重慶圖書館成為聯合國文獻完全托存圖書館，開始收集涵蓋聯合國及其所屬機構的全部文獻資料。聯合國文獻泛指聯合國及其下屬的專業機構（亦含附屬機構）出版的所有會議記錄文件和圖書資料。主要包括圖書、期刊、文件三個部分。圖書主要包括聯合國出版的年鑒、專題研究報告、條約匯編、各會議及專題議論會記錄、索引和各個專業機構出版物等，按主題主要分為十七類。期刊主要是指聯合國的主要機構、專業機構和其它獨立組織出版的期刊，包括定期和不定期的。截止2012年末，重慶圖書館有聯合國資料20余萬冊（件）。
民國文獻
重慶圖書館收藏有十幾萬冊民國文獻，包括民國時期圖書7萬多種，10余萬冊，其中抗戰版圖書有27000多種，6萬多冊。民國時期期刊5000余種，20000多冊，民國時期報紙300余種，7000多冊。內容涉及當時的政治、經濟、軍事、文化、教育、科學和體育各個領域。其中民國時期政府出版物的收藏包括從中央到地方的各級政府公報、會議紀要、法令法規以及議會、國會、舊政協、國民大會、國民黨各軍事機構、國民黨黨務方面的重要文獻；國民黨政界、軍界要人的傳記資料等，尤其是大量的、尚未公開出版的油印本內部資料，史料價值很高。 服務窗口服務內容壹樓兒童閱覽室憑證閱覽少兒書刊，憑少兒借閱證外借少兒書刊中文報刊閱覽區陳列有出版的期刊4100多種及或近幾個月報紙400余種，供閱覽中文過期報刊庫收藏2001年以來出版的期刊3000余種、報紙200多種的合訂本10余萬冊，憑借閱證填寫索書單，由工作人員入庫提取，供讀者閱覽，不外借讀者自修室有座位200多個，供讀者自習二樓 咨詢臺 解答讀者疑問 存包處 協助讀者存包總服務臺 辦理各種借閱證、閱覽證、臨時證，辦理讀者卡註冊、密碼恢復、退證。少年閱覽室 憑少兒借閱證外借少兒書刊 視障閱覽室 提供盲文書刊、音頻資料借閱服務，並提供盲人用電腦、書刊放大器等設備，供視力障礙人士使用 視聽閱覽室 提供各種內容的DVD、VCD等音像資料供讀者欣賞 電子閱覽室 提供各類電子期刊、報紙等全文數據庫供讀者查詢並可上互聯網 三樓中文圖書期刊借閱區收藏近10年出版的50萬冊中文圖書，供閱覽及外借。讀者憑讀者卡閱覽，憑借閱證外借。同時藏有出版的期刊600余種近20000份，供讀者閱覽及外借贈書閱覽室陳列捐贈的楊尚昆藏書。憑讀者卡閱覽臺港澳文獻閱覽室收藏中國臺港澳地區出版的中文圖書、期刊。憑讀者卡閱覽四樓參考咨詢部多名參考館員，依托重慶圖書館館藏資源、借助商業數據庫及館際合作的資源，為讀者提供各種層次的文獻咨詢服務工具書閱覽室收藏有社會科學、自然科學等各類中外文工具書，包括字典（詞典）、百科全書、年鑒、手冊、檢索工具書及專利、標準等聯合國文獻托存區收藏聯合國的中外文出版物和文件。聯合國出版物和文件主要反映聯合國的工作與關心的問題，如創造和平/維持和平、裁軍、經濟和社會發展、人權、國際法以及政府間合作等外文借閱區提供外文圖書、期刊的閱覽及部分外文圖書、期刊的外借服務。開架服務史迪威閱覽室收藏由美國駐成都總領事館和美國紐約人壽國際公司資助並贈送的英文原版圖書、期刊。實行開架閱覽，書刊可外借重慶地方文獻閱覽室收藏反映重慶地區政治、經濟、社會文化等方面的公開出版物和內部資料。主要包括：（1）重慶地方史誌、史料、統計資料等；（2）中國國內公開發行的內容涉及本地情況、本地較知名人士的著述；（3）革命歷史文獻，包括從“五.四”運動到中華人民***和國成立的各個歷史時期的革命文獻；（4）大事記、重慶地區年鑒；（5）部分家譜等抗戰文獻閱覽室提供中國民國時期出版的圖書期刊電子文檔的查閱、下載五樓基藏文獻閱覽室提供基藏書庫中的書刊報的閱覽，包括建國後出版的中文圖書、建國後至2000年間出版的中文期刊報紙、部分臺港澳版書刊報以及“中華再造善本工程”的善本圖書等縮微閱覽室收藏有部分古籍善本、建國前期刊、建國前後報紙、民國書籍等進行了縮微復制，並購置了國內其它圖書館制作的部分縮微資料民國文獻閱覽室提供中國抗戰文獻及民國其它時期出版的書刊報紙、解放後再版的民國文獻。讀者憑讀者卡閱覽古籍閱覽室藏有普通古籍、古籍善本13多萬種。讀者憑讀者卡、身份證、介紹信查閱