敦煌藏經90%以上屬於珍貴的漢傳佛經。長期以來，我們對敦煌文獻的利用大多集中在數量不足10%的非佛教文獻上，通過對文獻的解讀，補充了傳世史籍的空白。事實上，對“缺失”歷史的重視，恰恰成為了敦煌學轉型的動力。當非佛教文獻的補充史料價值被“擠出”後，“新資料”就會變成“舊資料”，這些非常珍貴有價值的歷史文獻應該得到更多的傳承和保護。
中國與朝鮮為伴，唐朝是當時佛教的鼎盛時期，也是記錄佛教在中國發展的關鍵歷史時期。敦煌文獻中保存的古彜文註釋是研究“八宗”發展演變的重要材料。由於敦煌僧人譚匡、法成的推動，在中原已經衰落的唯識宗在敦煌得以延續，唯識宗的壹些文獻也得以保存。晚唐時期，敦煌僧人利用他們的善心，撰寫了《百法論蜀》和《鈔》，甚至得到北京大德的認可，在內地流傳。中晚唐時期禪宗非常興盛，但在“安史之亂”和“會昌滅佛”之後，大量早期禪宗文獻丟失。8世紀敦煌文獻中的壹些禪宗著作對研究早期禪宗歷史具有重要價值。中世紀中國人寫的疑偽經書，被僧人拒絕，所以不能入藏，傳世的書也很少。而敦煌僧人並沒有嚴格意義上的懷疑和偽經概念，因此大量漢文佛經得以保存。
《齋文》、《秦麗文》和《易》,都是記載漢傳佛教儀軌並加以傳承的優秀經典。也是研究漢傳佛教在中國演變的生動樣本。齋文是僧人為信眾辦事所用的儀式文字。敦煌佛教文學作品，包括俗語、佛教歌曲和靈驗筆記，是我們了解佛教文學史上許多重要問題的重要資料。比如P.2066《凈土五會》包含了豐富的凈土佛歌，S.2679《南宗五環》和S.5567《禪門十二點》都是禪宗式的押韻佛歌。有壹些人在敦煌寫本中宣揚壹部經典的功效，比如“念誦金剛經的功德”(P.2094等。);還有人宣揚某壹行為的功德，如“轟動莊妍寺，唐大和尚史靜，誰鳴鐘”(S.381等。);也有崇拜壹個佛教神或和尚的人，如《流沙河和尚因緣》(第2680頁等。).它們是記錄中國歷史和漢傳佛教研究的珍貴典籍。
敦煌各類珍貴佛教文獻在深化佛教史研究、拓展圖書史方面的重要價值不言而喻，仍需各界學者的持續關註和挖掘。