泉州市檔案館目前館藏檔案134個全宗，近8萬卷，其中革命歷史檔案1個全宗，7卷；民國檔案1個全宗，120卷；建國後檔案132個全宗，7萬多卷。檔案的載體形態有紙質檔案、磁質檔案及部分實物檔案。
（壹）革命歷史檔案
革命歷史檔案主要是1928年至1949年間閩中地下黨組織發展情況及泉州地區分布情況，地下黨經費來源及其管理文件，黨員登記表，來往書信等。
（二）民國時期檔案
此全宗匯集了1949年前的國立海疆學校、晉江私立培元中學、泉州醫院、惠世醫院等的檔案。學校檔案主要有學生學籍檔案和校刊資料，此外，還有國民黨地方各級人員名錄及有關人員的任免，保安訓練所學員學籍表、國民黨政府刑事案卷、中***地下黨組織被摧毀材料等。
（三）中華人民***和國時期檔案
中華人民***和國時期檔案是泉州市解放以來黨政機關、社會團體、企事業單位形成的檔案，反映了本市五十多年來的政治、經濟、文化、教育和城市建設等方面的歷史面貌。主要內容有市委、市府及其所屬各工作部門制定的有關工、交、農、林、漁、城市管理、科學、文化、教育、衛生、體育等方面的政策、規章、決定；會議記錄；黨代會、人代會材料，政府工作、選舉工作、統戰工作的報告、決議、計劃、總結、情況匯報，幹部任免、黨紀處分、機構設置、體制調整的檔案材料；各種年報、統計報表；工、青、婦會議材料；表彰先進、評選勞模的材料；企業商業基本情況表、經濟情況簡報、對資改造等材料；優撫、復轉軍人安置、勞動力調配、勞動工資、招工等工作的通知、規定；僑務、宗教、文化、教育、衛生等方面的管理規定、計劃、總結、通知、表冊以及會計檔案、人口普查、婚姻登記、工業普查等專業檔案材料；城市規劃、水利建設、環保調查等科技檔案；“三反”、“五反”、審幹、肅反、“整風”、“社教”、“文革”等運動中形成的檔案材料，等等。
此外，泉州市檔案館還建立了題詞、名人、重大活動、印模等特色檔案，本館收藏國家領導人和社會名人的題詞30多張，大都為原件，其中有：1920年孫中山先生給培元中學的題詞“***進大同”；1980年宋慶齡給培元中學的題詞“為國樹人”；李鵬、李嵐清等原黨和國家領導人的題詞；謝覺哉、費孝通、朱學範等人的題詞，這些題詞鼓勵泉州人民弘揚泉州精神、振興經濟、發展教育、建設泉州社會主義新城。目前，館內已征集到23位泉州名人檔案近百卷，這些建檔的名人有書法家、作家、醫學專家、農業專家、表演藝術家等等，建檔的主要內容包括各種證書、獎章、自傳、事跡材料、照片、作品等。重大活動檔案是指征集到的近十年來全市壹些重大活動如“海絲”、“藝術節”、“旅遊節”等活動的檔案資料。印模檔案主要是泉州解放以來壹些黨委、政府機構廢舊的工作印章，館藏現有311枚。
（四）聲像、實物檔案
泉州市檔案館保存有不少聲像檔案，其中照片5千多幅，錄音、錄像、光盤***120盤。聲像檔案的主要內容有：泉州市50多年來經濟建設、文化藝術活動、重大歷史事件、各級領導視察考察工作等。
此外，館藏中還有實物檔案***700余件，包括字畫、題匾、器具、藝術品、印章等，這些物品主要是泉州市委、市政府在各種對外交流、外事活動中接受的各方禮贈，也有部分物品是社會熱心人士捐贈。
（五）圖書資料
泉州市檔案館館藏資料***2萬多冊，主要內容有：政策、法律文件匯編、泉州市國民經濟統計年鑒；地方史誌材料；宗教、同鄉會、研究會、僑務資料；報紙（人民日報、福建日報、泉州晚報和部分民國時期的報紙）、刊物以及城市規劃、氣象、自然災害等方面資料。圖書主要有公***圖書（包括哲學、社會科學、政治、經濟、歷史、地理、文學、法律法規）、工具書及泉州地方史誌，族譜等。