ミシロタウン(初始城鎮)
1:遊戲重新開始EVENT Δ章開始
2:下樓和老爹拿票
3:出門和迷之少女對話
4:去鄰居家對話
5:回自己家再重新出門然後再次拯救博士
101道路
1:救博士然後禦三家三選壹
2:去トウカシティ(老爹道場城市)
トウカシティ
1:城市西北方的小光家門口EVENT
2:戰鬥後通過ポケモンマルチナビ和大吾對話 然後去カナズミシティ(壹號道館城市)
カナズミシティ
1:去西北部的大樓前和大吾對話
2:進去接到社長委托去石の洞窟(第壹次遇見大吾的地方)
石の洞窟
1:最深處進行戰鬥,戰鬥後獲得隕石碎片
2:再次利用高科技和大吾對話 然後前往トクサネシティ(宇宙中心的城市)
トクサネシティ
1:去宇宙中心
2:和1樓最右邊的妹子對話後上樓和博士對話以及壹堆劇情
3:和大吾對話後前往流星の滝
流星の滝
1:攀瀑到上流 然後壹直前進
2:洞窟內部和大吾以及流星之民後裔對話
3:在流星之民處向南跳下 途中能撿到化石翼龍MEGA石
4:出來後前往カナズミシティ(壹號道館城市)
カナズミシティ
1:去找社長 進樓三連戰
2:和社員對話後前往トクサネシティ(宇宙中心城市)
トクサネシティ
1:在東邊發生劇情 追著對應的隊伍進入宇宙中心
2:1L最右邊戰鬥
3:上樓對話,戰鬥
4:戰鬥後回答迷之少女的問題,之後前往對應反派基地
敵方基地
1:壹路A進去
2:打倒BOSS後依據版本獲得不同MEGA石
3:再次用高科技和大吾對話,之後前往トクサネシティ(宇宙中心城市)
トクサネシティ
1:上宇宙中心2樓對話後前往ルネシティ(第八道館城市)
ルネシティ
1:在北方大樹下和變態對話 之後前往131水道
131番水道
1:向北走 然後登陸小島
2:和在門口的變態對話並戰鬥
3:戰鬥後穿過洞穴前往空柱
空柱
1:壹邊和迷之少女對話壹邊爬樓。
2:在樓頂回答問題,然後和70級MEGA綠毛蟲戰鬥,據日站說打死或者逃跑的話綠毛蟲也會無限復活到妳抓到為止。
3:捕獲後從少女處學到畫龍點睛,之後進行戰鬥。
4:戰鬥後乘著綠毛蟲飛到宇宙,在隕石中心和代歐奇希斯戰鬥。
5:戰鬥後回到空柱,然後Δ章ED,回到初始城鎮。
三周目
ミシロタウン
1:下樓和老爹拿票
2:老娘給MEGA石(版本不同有區別)
3:出門去101路
101番道路
1:再次拯救博士……並且選擇禦三家
バトルリゾート(邊疆)
1:從任意港口登船。
2:下船處和小光對話,之後和反派對話,然後拿版本對應MEGA石。
3:過橋往北走,然後在上島的地方的男性處獲得バトルレコーダー(戰鬥記錄儀?)。
4:在東邊沙灘發生時間,回答漂流者問題,然後前往東邊過橋處的小屋,接受漂流者送MEGA石。
5:去島的東北沙灘的小屋中,撿到MEGA石。
6:去島中央的戰鬥屋,在入口處和四天王的老壹對話,挑戰戰鬥屋。
ポケモンリーグ
1:打敗四大天王和大吾後進入殿堂。
2:ED ED後回到初始城鎮。
暫時無四周目信息。