微笑中有四種情感。
借助計算機“情緒識別軟件”，
科學家發現，蒙娜麗莎的微笑包含四種情緒:83%快樂、9%厭惡、6%害怕和2%憤怒。
該軟件首先根據數據庫中的年輕女性面部制作壹個“通用表情”模板，然後通過將嘴唇和眼睛周圍皺紋的弧度等關鍵面部特征與該模板進行比較來識別人類的情緒。目前，這款軟件可以識別六種基本情緒:快樂、驚訝、憤怒、厭惡、恐懼和悲傷。
微笑的真正含義仍然是壹個謎。
參與這項研究的托馬斯·黃(Thomas Huang)教授坦言，為什麽蒙娜麗莎會同時有這些矛盾的情緒，“為了更準確地解讀蒙娜麗莎的微笑，我們需要與心理學家和藝術家壹起探討人類面部微妙表情背後的真正意義。”
英國格拉斯哥大學的心理學家辛西婭·麥克維(Cynthia McVey)試圖從心理學的角度分析《蒙娜麗莎》的矛盾心理。“達芬奇想畫她，這讓蒙娜麗莎很開心。但是她有點反感被壹個老頭畫。生氣的原因是她坐在那裏很久了，但是達芬奇還沒有畫完。”
英國倫敦大學的唐納德·薩森(Donald Sasson)教授認為，達芬奇刻意隱藏了模特的真實情感，從而給人留下了巨大的想象空間。
達芬奇認為人是最神聖的。人體是自然界中最美的形象。他多次測量證明，人體各部分之間的比例是整數比，所以人體呈現出最和諧的美，被稱為“神聖比例”。他說:“誰不尊重生命，誰就不配擁有生命。”《蒙娜麗莎》正是他用真正的女性微笑贊美人類的美好，呼喚人性的覺醒，贊美生命的可愛。體現了他的人生哲學。
蒙娜麗莎的右手被認為是世界藝術史上最美麗的手，雖然科學發達的現代攝影技術高超，但如果我們將這只手與現代攝影相比較，人們仍然可以看到這只手更有體積感、重量感和生命力。幾乎完全在中指間隙，人們仿佛能聽到音樂的美妙，感受到蒙娜麗莎那壹刻的喜悅。現代攝影很難記錄這種內在的魅力。
16世紀初的很多畫家，往往註重的是人物的端正，輪廓的嚴密，線條的準確，細節的清晰，結果他們的圖像往往是毫無生氣的。壹個死板的“睡美人”出現了，只有達芬奇把生動性提升到了壹個更高的層次；塑造了許多生動的形象。然而，自《蒙娜麗莎》出版以來，人們推崇和爭論不休的正是蒙娜麗莎的“神秘微笑”。蒙娜麗莎“神秘的微笑”是什麽原因？她的微笑是什麽意思？有人說這是“迷人的微笑”，有人說這是“邪惡的微笑”，有人認為這是不可理解的神秘微笑，這是壹個永恒的謎。其實從圖片上看到的蒙娜麗莎的微笑是壹種自信和樂觀從容的氣度。而這正是中世紀漫長黑暗之後發生的事情。人們正從基督教神學的壓力中覺醒，去追求新生活的特征。
畫中的蒙娜麗莎不僅展示了她的溫雅、高貴和幸福，還展示了她在新世界和新生活中的喜悅和快樂。這裏沒有懷疑和恐懼，也沒有中世紀畫家作品中人物呆板、冷酷、對世界充滿恐懼的痕跡。與中世紀肖像畫中毫無生氣的人是上帝的奴隸不同，蒙娜麗莎是壹個充滿青春和活力的生動形象。達芬奇用他的《蒙娜麗莎》展現了那個大時代人們新的精神面貌，揭示了人們對新生活的向往、樂觀和自信。同時，他也表達了對擺脫上帝束縛的人們及其美好的熱烈贊美。蒙娜麗莎的微笑賦予了這個人物無限的意境。無論是其自身的和諧詩意，還是其深刻廣泛的社會學和歷史學意蘊，都達到了無與倫比的高度。從這個角度來看，蒙娜麗莎的微笑也是絕唱。在蒙娜麗莎的身上，理性的原則與崇高的詩意、崇高的精神與生動的肉體、情感與理智、科學與藝術都和諧而完美地統壹了。這是文藝復興時期人的完整形象。它是人類歷史進程中人的全面發展的傑出範例。《蒙娜麗莎》展現了偉大的時代思想意蘊和驚人的藝術造詣深度，因此幾個世紀以來人們壹直對其永恒的魅力充滿熱情。達·芬奇畫完這幅畫後，壹直把它當作珍寶帶在身邊。直到他去世，才被法國國王弗朗西斯壹世收藏。現在這幅畫被珍藏在巴黎的盧浮宮博物館。