這種操作不僅不安全，還會造成中藥的浪費，甚至破壞中藥的功能，降低療效。如果是袋裝中藥湯劑，直接放在微波爐裏加熱，溫度會迅速升高，導致包裝袋爆裂，中藥飛濺，存在安全隱患。
如果將中藥倒入容器中，用微波爐加熱，溫度會迅速升高，液體會溢出容器，造成中藥湯劑的浪費。
如果中藥中含有刺激性中藥，有效成分容易揮發，用微波爐加熱容易破壞有效成分，降低療效。