1.微生物菌劑的優點，環保:微生物菌劑是壹種生物農藥，主要由微生物及其代謝產物組成，不會對環境造成汙染和危害，對環境保護具有重要意義。高效安全:菌劑具有針對性，可防治特定病蟲害，作用持久，不會對人畜造成傷害，安全可靠。增效減害:微生物菌劑可以改善土壤環境，提高作物對水分和養分的利用效率，減少化肥和農藥的使用，減少對土地的破壞。
2.微生物菌劑的缺點，使用不方便:微生物菌劑的制備和使用工藝復雜，對使用者的技術要求高，操作不當可能會影響效果。技術不成熟:微生物菌劑的生產技術和質量控制技術目前尚未達到成熟水平，存在質量和效果不穩定的風險。價格較高:由於微生物菌劑生產和應用成本高，其價格高於化學農藥，在壹定程度上制約了其推廣應用。