A/O法生物去除氨氮的原理:在充氧條件下(O階段)，汙水中的氨氮被硝化細菌硝化成硝態氮，大量的硝態氮回流到A階段。在缺氧條件下，汙水中的有機物作為電子供體，硝態氮作為電子受體，使硝態氮波還原為無汙染的氮，逃逸到大氣中，達到反硝化的最終目的。
硝化反應:NH4++2o2→ NO3-+2h+H2O。
逆消化反應:6NO3-+5CH3 OH(有機物)→ 5CO2 ↑+7H2O+6OH-+3N2 ↑。