1，不利的自然環境條件。海水養殖苗種培育和海洋牧場建設需要海水養殖水質和營養，但大部分海水中微生物氨氮超標，制約和影響了海水養殖苗種培育和海洋牧場建設。
2、飼料營養不良。海水養殖苗種往往以農作物為主要營養來源，營養成分會與人群需求不符，因此沒有準確的養殖和營養攝入。