藻類也能降解有機磷，如磷菌、對硫磷等。
降解方式主要有兩種:壹種是微生物本身含有能夠降解磷的酶基因。另壹個是沒有微生物自身降解磷的酶系統。當磷進入環境後，由於微生物生存的需要，微生物的基因在適應環境的過程中發生重組或突變，產生新的降解磷的酶系統。