冬瓜喜溫耐熱，對低溫敏感，不耐低溫貯藏。10℃以下會發生冷害，適宜的貯藏溫度為10-15℃，相對適中的溫度為70%-75%，要求通風良好。
冬瓜含水量高，嫩瓜和過熟瓜都不適合儲藏。貯藏的黑皮冬瓜要九成熟，皮厚肉厚，質地致密，品質好，表面綠亮，蠟滿。
儲存溫度過高，呼吸速率加快，組織迅速變軟，致病菌迅速繁殖，儲存期不長。
冬瓜貯藏前的準備
采摘前7-10天，生長地應停止灌溉。應該在早上氣溫低，瓜涼的時候采摘。為了防止受傷，避免病菌入侵，用剪刀剪去藤蔓，留3厘米左右的花梗為宜。雨天禁止收割，入庫前防雨。因為雨後瓜的含水量太高，不宜雨後采摘。
在搬運、裝卸時，壹定要堅持輕搬運、輕裝載、輕運輸、輕卸載的原則，不要滾動、碰撞，否則容易造成倒漿損壞，不利於儲存。