1.技術應用方向不同:軍民融合工程是以軍事技術為基礎，應用於民用領域，具有雙重性，旨在提高國防實力和經濟發展水平。而傳統項目主要以民用技術為主。
2.投資體制不同:軍民融合項目具有高度的國家戰略性和政策導向性，通常采用政府引導或政府引導與市場投資相結合的方式進行資金投資和管理。傳統項目相對獨立，投資和資金管理方式壹般由市場機制決定。